AACR GENIE BPC前列腺癌公开队列

资源简介

AACR GENIE BPC前列腺癌公开队列

【一句话概览】

AACR Project GENIE BPC 前列腺癌 v1.0-public 数据集包含来自 MSK、DFCI、UHN 和 VICC 四家机构的 1,116 名前列腺癌患者。部分数据可通过 cBioPortal 访问，基因组与临床数据可在该平台进行探索和可视化，完整后处理数据发布于 Synapse。数据涵盖 2013 至 2018 年间的临床级二代测序，患者测序时年龄为 37 至 88 岁。内容包括前列腺癌特异性字段、病理信息、治疗史、影像信息、肿瘤科医生评估及总生存等（来源 aacr.org）。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《BPC Prostate v1.0-public》。

【数据内容】

源站原始描述：The AACR Project GENIE® BPC Prostate v1.0-public dataset contains 1,116 prostate cancer patients from 4 institutions: MSK, DFCI, UHN and VICC. Data Access: A subset of the data is available through cBioPortal. Both the genomic and clinical (phenomic) data can be evaluated in cBioPortal with opportunities for data exploration and visualization using a user-friendly interface. The complete, post-processed data are available on Synapse. See an overview of the data set. What is included in AACR Proj…

中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：AACR Project GENIE® BPC Prostate v1.0-public数据集包含来自4家机构的1，116例前列腺癌患者：MSK、DFCI、UHN和VICC。数据获取：部分数据可通过cBioPortal获取。基因组和临床（表型）数据均可在cBioPortal中查看，并可通过用户友好的界面进行数据探索和可视化。完整的后处理数据可在Synapse上获取。查看数据集概览。AACR Project GENIE BPC数据包含哪些内容？基因组数据：来自AACR Project GENIE®注册库的每例患者的临床级下一代测序数据。基因组分析于2013年至2018年间进行；患者在基因组测序时的年龄为37-88岁。癌症诊断：前列腺癌诊断被视为该患者队列的原发肿瘤。数据中包含前列腺癌之前和之后的其他癌症诊断信息。前列腺癌特异性字段：包括肿瘤内科医生对激素/去势/雄激素非依赖状态的评估、PSA水平变化的评估、PSA和睾酮实验室值、病理报告中记录的最高Gleason评分、切除标本的边缘状态，以及所有前列腺标本中的特殊组织学模式。病理信息：从诊断到死亡或末次随访的每个病理标本均标注了标本类型、部位和组织学。治疗史：数据集包含所有抗肿瘤全身治疗——静脉和口服化疗。日期以从诊断到每种药物开始和停止的时间间隔提供。研究性药物已遮蔽；不包含剂量信息。影像学信息：从诊断到死亡或末次随访的每次CT、MRI、PET-CT扫描均标注了癌症的存在或不存在，以及癌症是稳定、缓解还是进展的评估。这些数据用于计算影像学无进展生存期（PFS-I）。肿瘤累及部位也有记录。肿瘤内科医生评估：肿瘤内科记录（每月1次）已经过标注，以确定癌症的存在或不存在以及癌症是稳定、缓解还是进展。这些数据用于计算从诊断到死亡或末次随访日期的内科医生评估无进展生存期（PFS-M）。总生存期：总生存

【主题与分类】

主题标签：prostate cancer、genomic、clinical、imaging、AACR Project GENIE、BPC、PRISSMM。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面：https://www.aacr.org/professionals/research/aacr-project-genie/bpc/bpc-prostate-1-0/