基于RNA测序数据识别特发性男性不育症潜在关键基因的计算机模拟方法
该数据集基于公开的RNA测序数据(GSE65683),包含特发性男性不育症患者三组精子样本的基因表达数据,通过差异表达基因分析、富集分析和蛋白质相互作用网络构建,识别出ACTB、BTBD6、EIF2S3等关键枢纽基因,主要用于研究特发性男性不育的分子机制,并为发现新的诊断标志物和治疗靶点提供数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集源自公开的RNA测序数据(GSE65683),旨在探究特发性男性不育症的分子机制。数据集包含三组患者的精子样本:定时性交组(TIC)、宫腔内人工授精组(IUI)和辅助生殖技术组(ART)。通过差异表达基因(DEG)分析,共识别出TIC组118个、IUI组446个、ART组188个差异表达基因。研究进一步利用DAVID和GeneCodis进行富集分析,并通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,计算网络参数(如度中心性和中介中心性)以筛选关键枢纽基因,如ACTB、BTBD6、EIF2S3等。该数据集主要用于揭示特发性男性不育的分子基础,为诊断标志物发现和治疗靶点开发提供依据。
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数据说明
该数据集源自公开的RNA测序数据(GSE65683),旨在探究特发性男性不育症的分子机制。数据集包含三组患者的精子样本:定时性交组(TIC)、宫腔内人工授精组(IUI)和辅助生殖技术组(ART)。通过差异表达基因(DEG)分析,共识别出TIC组118个、IUI组446个、ART组188个差异表达基因。研究进一步利用DAVID和GeneCodis进行富集分析,并通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,计算网络参数(如度中心性和中介中心性)以筛选关键枢纽基因,如ACTB、BTBD6、EIF2S3等。该数据集主要用于揭示特发性男性不育的分子基础,为诊断标志物发现和治疗靶点开发提供依据。
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