基于RNA测序数据识别特发性男性不育症潜在关键基因的计算机模拟方法
该数据集基于公开的RNA测序数据（GSE65683），包含特发性男性不育症患者三组精子样本的基因表达数据，通过差异表达基因分析、富集分析和蛋白质相互作用网络构建，识别出ACTB、BTBD6、EIF2S3等关键枢纽基因，主要用于研究特发性男性不育的分子机制，并为发现新的诊断标志物和治疗靶点提供数据支持。
基本信息
资源简介
基于RNA测序数据识别特发性男性不育症潜在关键基因的计算机模拟方法
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Identification of potential key genes related to idiopathic male infertility using RNA-sequencing data: an in-silico approach》。配套论文《Identification of potential key genes related to idiopathic male infertility using RNA-sequencing data: an
<i>in-silico</i>
approach》发表于 Human Fertility（2022），DOI：10.1080/14647273.2022.2144771。源站首次发布：2022-11-24。
【数据内容】
源站原始描述：Among reproductive health problems, idiopathic infertility affects married couples. The current diagnosis of male infertility focuses on the concentration, motility, and morphology of sperm in the ejaculate. Since the molecular mechanism of idiopathic infertility is unknown, identification of Differentially Expressed Genes (DEGs) among the control and idiopathic infertile male can shed light on diagnosis and treatment. Here, we analyzed the dataset GSE65683 to identify DEGs in idiopathic human s…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 1.10 MB。ihuf_a_2144771_sm7051.pptx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.presentationml.presentation，1.04 MB。ihuf_a_2144771_sm6979.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，63.59 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.21546141.v2。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Biological Sciences not elsewhere classified、Information Systems not elsewhere classified。主题标签：Idiopathic infertility、differentially expressed genes、hub genes、gene ontology、pathways、network analysis、in silico。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Biological Sciences not elsewhere classified、Information Systems not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_potential_key_genes_related_to_idiopathic_male_infertility_using_RNA-sequencing_data_an_i_in-silico_i_approach/21546141
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Identification of potential key genes related to idiopathic male infertility using RNA-sequencing data: an in-silico approach. Taylor & Francis. Lukkani, Laxman Kumar; Naorem, Leimarembi Devi; Muthaiyan, Mathavan; Venkatesan, Amouda
【使用注意】
· 源站最后修改于 2026-06-09，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集源自公开的RNA测序数据（GSE65683），旨在探究特发性男性不育症的分子机制。数据集包含三组患者的精子样本：定时性交组（TIC）、宫腔内人工授精组（IUI）和辅助生殖技术组（ART）。通过差异表达基因（DEG）分析，共识别出TIC组118个、IUI组446个、ART组188个差异表达基因。研究进一步利用DAVID和GeneCodis进行富集分析，并通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，计算网络参数（如度中心性和中介中心性）以筛选关键枢纽基因，如ACTB、BTBD6、EIF2S3等。该数据集主要用于揭示特发性男性不育的分子基础，为诊断标志物发现和治疗靶点开发提供依据。
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