GSE43790急性肾盂肾炎相关表达数据

包含急性细菌感染或肾盂肾炎相关宿主表达数据,可用于感染炎症反应、诊断特征和肾感染分类模型探索。

Gene Expression OmnibusGene Expression Omnibus
NCBI GEO
2013-01-01 更新
浏览 37
表格分类Expression profiling by arrayGPL69479606
GSE43790 Pyelonephritis Expression Dataset

基本信息

模态
表格
大小
0.006501344 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2013-01-01

资源简介

GSE43790急性肾盂肾炎相关表达数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Expression data profile of A498 cells inoculated with E. coli 83972 and E. coli CFT073》。源站首次发布:Jan 27 201。

【数据内容】

源站原始描述:Urinary tract infections (UTIs) constitute a highly relevant model of microbial adaptation, in which the contrasting effects of pathogens and commensals on host tissues are clearly displayed. While virulent Escherichia coli cause severe, potentially life-threatening disease by breaking the inertia of the mucosal barrier and infecting the kidneys, the most common outcome of bacteriuria is an asymptomatic carrier state resembling commensalism at other mucosal sites. It remains unclear if the lack…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6947、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE43790

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 16 201,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含急性细菌感染或肾盂肾炎相关宿主表达数据,可用于感染炎症反应、诊断特征和肾感染分类模型探索。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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