利用hPSCs建模FSHR功能

该数据集来自omicsdi.org,聚焦于利用hPSCs建模FSHR功能,属于泌尿生殖系统疾病中的不孕症方向。研究在HEK293细胞中表达MAC标签的FSH受体(FSHR),通过亲和纯化质谱分析,考察FSHR在静息状态及FSH刺激下的相互作用组

omicsdi
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时间序列分类Proteomics
Modeling FSHR function with hPSCs

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

利用hPSCs建模FSHR功能

该数据集英文名为 Modeling FSHR function with hPSCs,来源于 omicsdi.org,聚焦于泌尿生殖系统疾病中的不孕症方向,主题标签为 Proteomics。研究围绕卵泡刺激素受体(FSHR)的功能建模展开,利用人多能干细胞(hPSCs)相关体系,并在 HEK293 细胞中表达带有 MAC 标签的 FSHR,通过亲和纯化质谱分析,系统考察 FSHR 在静息状态以及 FSH 刺激条件下的相互作用组。源站描述指出,卵泡刺激素(FSH)在生殖功能的发育和调控中具有关键作用,而该研究共鉴定出野生型 FSHR 的 19 个特异性高置信度相互作用蛋白,以及 A189V 突变型 FSHR 的 14 个特异性高置信度相互作用蛋白,其中若干相互作用蛋白已被证实与不孕症相关。整体而言,该数据集为理解 FSHR 在正常与突变状态下的蛋白互作网络提供了质谱层面的实验数据支撑。

【数据集背景】

卵泡刺激素(FSH)在生殖功能的发育与调控过程中扮演着至关重要的角色。FSHR 作为其受体,其功能状态与下游信号传导及蛋白相互作用网络密切相关。该数据集以 Modeling FSHR function with hPSCs 为题,旨在利用人多能干细胞(hPSCs)体系对 FSHR 功能进行建模研究。研究关注的核心问题包括 FSHR 在静息状态与 FSH 刺激状态下的相互作用组差异,以及野生型 FSHR 与 A189V 突变型 FSHR 在相互作用蛋白组成上的异同。由于部分相互作用蛋白已被发现与不孕症存在关联,该数据集所涉及的研究方向归属于泌尿生殖系统疾病中的不孕症领域,主题标签为 Proteomics。

【数据内容】

该数据集所涵盖的数据内容为基于亲和纯化质谱分析获得的 FSHR 相互作用组数据。具体而言,研究在 HEK293 细胞中表达带有 MAC 标签的 FSH 受体(FSHR),随后通过亲和纯化质谱分析,分别考察 FSHR 在静息状态以及 FSH 刺激条件下的相互作用情况。根据源站描述,该研究共鉴定出野生型 FSHR 的 19 个特异性高置信度相互作用蛋白,以及 A189V 突变型 FSHR 的 14 个特异性高置信度相互作用蛋白。在这些相互作用蛋白中,有若干已被证实与不孕症相关。数据集的主题标签为 Proteomics,表明其数据类型属于蛋白质组学范畴。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。其源站描述表明,研究采用 HEK293 细胞作为表达体系,在其中表达 MAC 标签的 FSHR,并开展亲和纯化质谱分析。实验设计涵盖两种受体状态:野生型 FSHR 与 A189V 突变型 FSHR;同时涵盖两种功能状态:静息状态与 FSH 刺激状态。通过上述实验流程,研究者得以比较不同条件下 FSHR 相互作用组的组成差异。关于样本的具体制备细节、质谱仪器型号、实验重复次数、数据分析软件及统计方法等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于蛋白质组学与生殖医学交叉领域的研究场景。具体而言,可用于探讨 FSHR 在静息状态与 FSH 刺激状态下的相互作用组差异,比较野生型 FSHR 与 A189V 突变型 FSHR 的相互作用蛋白组成,以及分析与不孕症相关的潜在相互作用蛋白。此外,该数据集亦可为利用 hPSCs 建模 FSHR 功能的相关研究提供质谱层面的参考数据。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,源站未提供。包括但不限于数据下载方式、文件格式说明、数据处理流程、分析工具推荐以及结果复现步骤等信息,均未在源站描述中给出。

【质量与限制】

该数据集所涉及的相互作用蛋白均标注为“特异性高置信度相互作用蛋白”,其中野生型 FSHR 对应 19 个,A189V 突变型 FSHR 对应 14 个。这一标注表明研究者在结果筛选时采用了高置信度标准。然而,关于该数据集的质量评估指标、假阳性率、覆盖度、重复性验证结果,以及实验体系(HEK293 细胞过表达系统)与生理条件之间的差异所带来的局限性,源站未提供。此外,该数据集在 hPSCs 建模方面的具体实验细节及其与 HEK293 细胞实验之间的关系,源站亦未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000088577

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

促卵泡激素(FSH)在生殖功能的发育和调节中至关重要。我们在HEK293细胞中表达了带有MAC标签的FSH受体(FSHR),随后进行亲和纯化质谱分析,以研究FSHR在静息状态及FSH刺激后的相互作用组。总共鉴定出19个与野生型FSHR特异性高置信度相互作用的蛋白,以及14个与A189V突变型FSHR相互作用的蛋白,其中数个与不孕症相关。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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