2.5 dpc 雌性 HPG 轴 Kdm4a 野生型与敲除小鼠 RNASeq
该数据集为 2.5 dpc 雌性小鼠 HPG 轴的 RNA-Seq 数据，涵盖 8-10 周龄同窝雌性对照与 Kdm4a 敲除小鼠的下丘脑、垂体、卵巢和子宫
基本信息
资源简介
2.5 dpc 雌性 HPG 轴 Kdm4a 野生型与敲除小鼠 RNASeq
2.5 dpc female HPG axis RNASeq of Kdm4a wildtype and knockout mice
该数据集为 2.5 dpc 雌性小鼠 HPG 轴的 RNA-Seq 数据，涵盖 8-10 周龄同窝雌性对照与 Kdm4a 敲除小鼠的下丘脑、垂体、卵巢和子宫。通过比较基因表达变化，可评估与雌性不孕表型相关的生理学改变，并帮助确定最相关的组织，以便后续开展 Kdm4a、H3K4me3 和 H3K9me3 的全基因组 ChIPSeq 结合谱分析，从而揭示可能受 Kdm4a 直接调控的靶基因（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 16 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目的：我们对 2.5dpc 小鼠下丘脑、垂体、卵巢和子宫（来自 8-10 周龄同窝雌性对照与 Kdm4a 敲除小鼠）进行了 RNA-Seq。在观察到与所观察到的雌性不孕表型生理相关的基因改变程度后，这将有助于我们缩小最相关的组织范围，以进行 Kdm4a、H3K4me3 和 H3K9me3 的全基因组 ChipSeq 结合谱分析。该数据集将呈现可能受 Kdm4a 直接控制的靶基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL19057、10090。本站分类：泌尿生殖系统疾病/不孕症。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE96685
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE96685
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的：我们对8-10周龄同窝雌性对照小鼠和Kdm4a敲除小鼠的2.5dpc下丘脑、垂体、卵巢和子宫进行了RNA-Seq。通过观察与所观察到的雌性不育表型生理相关性 altered genes 的程度，这将有助于我们缩小最相关的组织范围，以进行Kdm4a、H3K4me3和H3K9me3的全基因组ChipSeq结合谱分析。该数据集将呈现可能受Kdm4a直接控制的靶基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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