hnRNPL调控联会基因与mTOR剪接影响原始卵泡形成与激活

研究围绕围产期原始卵泡池建立过程,探索可变剪接动态,并鉴定剪接调控因子hnRNPL在原始卵泡池形成中的关键作用。数据可用于分析生殖细胞发育与卵泡形成相关的剪接事件及基因表达变化(来源 NCBI)

geo
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基因组预测GPL2127310090
GSE282407: hnRNPL modulates synapsis gene and mTOR splicing to influence primordial follicle formation and activation

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

hnRNPL调控联会基因与mTOR剪接影响原始卵泡形成与激活

hnRNPL modulates synapsis gene and mTOR splicing to influence primordial follicle formation and activation

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE282407_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱,物种为小鼠(10090),平台GPL21273。研究围绕围产期原始卵泡池建立过程,探索可变剪接动态,并鉴定剪接调控因子hnRNPL在原始卵泡池形成中的关键作用。数据可用于分析生殖细胞发育与卵泡形成相关的剪接事件及基因表达变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):围产期建立的原始卵泡池是卵母细胞的终身来源,其耗竭会导致卵巢早衰。在原始生殖细胞(PGC)发育和原始卵泡形成过程中,生殖细胞发育受到精确转录调控,并伴随广泛转录后可变剪接(AS)事件。AS在PGC发育和卵泡形成中的作用仍知之甚少。在本研究中,我们探索AS动态,并鉴定剪接调控因子hnRNPL是原始卵泡池形成的关键因素。利用条件性敲除(cKO)模型,我们证明在减数分裂前生殖细胞中缺失hnRNPL会损害参与同源联会和自噬的基因的剪接,导致卵母细胞停滞、卵泡池尺寸减小和加速的o

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21273、10090。本站分类:泌尿生殖系统疾病/不孕症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE282407

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

围产期建立的原始卵泡池是卵母细胞的终身来源,其耗竭会导致卵巢早衰。在原始生殖细胞(PGC)发育及原始卵泡形成过程中,生殖细胞发育受精确的转录调控,并伴随广泛的转录后可变剪接(AS)事件。AS在PGC发育及卵泡形成中的作用尚不清楚。本研究探讨了AS的动态变化,并鉴定出剪接调控因子hnRNPL是原始卵泡池形成的关键因子。利用条件性敲除(cKO)模型,我们证明减数分裂前生殖细胞中hnRNPL的缺失会损害参与同源联会和自噬的基因的剪接,导致卵母细胞停滞、卵泡池缩小和卵巢衰老加速。过度自噬加剧卵母细胞闭锁,进一步导致不育。我们的研究结果突显了hnRNPL是卵母细胞发育中AS的关键调控因子,并为在原始卵泡形成受阻的情况下挽救生育力提供了潜在的治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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