IVF后反复种植失败子宫内膜基因表达数据集
该数据集来自 omicsdi.org,为一项病例对照研究,通过分析子宫内膜活检样本的基因表达,探究体外受精(IVF)后反复胚胎种植失败的机制
基本信息
资源简介
IVF后反复种植失败子宫内膜基因表达数据集
该数据集英文名为 Endometrial gene expression in recurrent implantation failure after IVF,聚焦于体外受精(IVF)后反复胚胎种植失败这一不孕症临床问题,属于泌尿生殖系统疾病/不孕症分类。数据集来源于 omicsdi.org,是一项病例对照(patient-control)研究项目,通过分析子宫内膜活检样本的基因表达,探究反复胚胎种植失败的机制。其主题标签为转录组学(Transcriptomics),核心数据为子宫内膜活检样本的基因表达信息,可用于比较病例组与对照组之间的表达差异。整体而言,该数据集以转录组层面的表达分析为手段,服务于对IVF后反复种植失败这一生殖医学难题的机制探索,适合关注子宫内膜容受性、胚胎种植失败及不孕症相关转录组研究的人员参考使用。
【数据集背景】
反复胚胎种植失败是体外受精治疗中较为棘手的临床情形,其机制涉及胚胎与子宫内膜之间的相互作用,而子宫内膜的基因表达状态是理解这一过程的重要切入点。该数据集正是围绕这一背景设立,以病例对照研究的设计,对IVF后反复胚胎种植失败患者的子宫内膜活检样本进行表达分析,试图从转录组层面揭示与种植失败相关的表达特征。数据集归入泌尿生殖系统疾病/不孕症分类,主题标签为转录组学,体现了其在生殖医学与组学分析交叉领域中的定位。
【数据内容】
该数据集的内容为子宫内膜活检样本的基因表达数据,来源于一项病例对照研究项目。研究以反复胚胎种植失败为观察对象,通过表达分析比较病例与对照之间的差异。主题标签标明其属于转录组学范畴,说明数据主体为转录组层面的表达测量结果。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、基因数量、具体检测平台及数据文件格式的进一步说明。
【采集与来源】
数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,该项目通过分析子宫内膜活检样本的表达情况来研究反复胚胎种植失败,采用病例对照(patient-control)的研究组织方式。样本类型为子宫内膜活检组织。关于采集地点、采集时间、伦理审批及具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与不孕症及辅助生殖相关的转录组研究场景,例如探讨IVF后反复胚胎种植失败中子宫内膜基因表达的变化,或作为病例对照表达分析的参考数据。其主题标签为转录组学,也可用于组学数据的整合分析与方法学比较。具体应用方向需结合使用者自身研究设计判断,源站未提供专门的应用说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用说明,包括数据获取方式、文件组织格式、预处理步骤及分析流程等均未在现有信息中体现。使用者需依据来源站 omicsdi.org 的相应条目自行了解获取途径与使用条件。
【质量与限制】
该数据集为病例对照研究项目产生的表达数据,其设计围绕反复胚胎种植失败与对照之间的比较。关于样本量、数据完整性、质控指标、批次效应及验证情况,源站未提供相关信息,因此无法对数据质量作出具体评价。使用时应注意到现有描述较为概括,缺乏对数据规模与技术细节的说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者如需引用或再利用,应查阅 omicsdi.org 上对应条目的说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-2591
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Patient-control group project investigating recurrent failure of embryo-implantation by expression analysis of endometrium biopsies
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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