GSE48075膀胱癌表达数据

包含膀胱癌样本表达矩阵,常与TCGA和其它GEO队列联合,用于生物标志物筛选和分类模型验证。

Gene Expression OmnibusGene Expression Omnibus
NCBI GEO
2013-01-01 更新
浏览 37
表格分类Expression profiling by arrayGPL69479606
GSE48075 Bladder Cancer Expression Data

基本信息

模态
表格
大小
0.052638688 GB
数据量
73
任务类型
分类
创建/更新时间
2013-01-01

资源简介

GSE48075膀胱癌表达数据

【一句话概览】

该数据集标题为“Identification of subsets of urothelial carcinoma”,原始描述为“Identification of bladder cancer subsets”,包含1个文件,源站标签涉及Expression profiling by array、GPL6947和9606(来源 NCBI)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Identification of subsets of urothelial carcinoma》。源站首次发布:Jun 18 201。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6947、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48075

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 22 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48075

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含膀胱癌样本表达矩阵,常与TCGA和其它GEO队列联合,用于生物标志物筛选和分类模型验证。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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