良性前列腺增生上皮与间质差异表达基因数据集
该数据集来自 ebi.ac.uk,收录良性前列腺增生患者上皮与间质组织的基因表达谱。研究者通过激光显微切割从8例经尿道前列腺电切术(TURP)患者的前列腺组织中分离上皮和间质,用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 基因芯片检测并比较基因表达水平,总RNA等量混合后上样

基本信息
资源简介
良性前列腺增生上皮与间质差异表达基因数据集
Different expressed genes in epithelium and stromal of Benign Prostatic Hyperplasia
该数据集来自 ebi.ac.uk,收录良性前列腺增生患者上皮与间质组织的基因表达谱。研究者通过激光显微切割从8例经尿道前列腺电切术(TURP)患者的前列腺组织中分离上皮和间质,用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 基因芯片检测并比较基因表达水平,总RNA等量混合后上样。数据可用于筛选上皮与间质中差异表达及高丰度表达的基因,并探讨这些基因在良性前列腺增生发病机制中的作用(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):为鉴定良性前列腺增生(BPH)上皮与间质中差异表达的基因,我们通过激光显微切割从良性前列腺增生患者中采集上皮与间质,随后使用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 基因芯片检测并比较基因表达水平,以找出在上皮与间质中表达最丰富的基因以及这些基因在BPH发病机制中的作用。在知情同意下,从接受经尿道前列腺电切术(TURP)的患者中采集了8份前列腺组织。每份组织包埋于O.C.T中,随后用于激光显微切割。从每份样本中分离总RNA,并等量混合用于基因芯片检测。
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:泌尿生殖系统疾病/良性前列腺增生。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-31323
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-31323
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-31323 良性前列腺增生上皮与间质差异表达基因的微阵列转录谱分析 EFO EFO_0002768 智人 为鉴定良性前列腺增生(BPH)上皮与间质中差异表达的基因,我们收集
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




