基于iTRAQ的喉癌转移相关S100钙结合蛋白A2定量蛋白质组学分析数据
该数据集是一个基于iTRAQ技术和质谱分析的蛋白质组学数据集,包含15对喉癌组织与癌旁正常组织的蛋白质表达谱数据,鉴定出100种差异表达蛋白,并重点验证了S100A2等蛋白在喉癌转移中的功能,主要用于研究喉癌的发病机制、寻找生物标志物和探索潜在的治疗靶点。
基本信息
资源简介
该数据集是一个针对喉癌(头颈部最常见的鳞状细胞癌)的蛋白质组学数据集。研究采用iTRAQ(等重同位素标记相对和绝对定量)技术和质谱分析,对15对喉癌组织与癌旁正常组织样本的蛋白质表达差异进行了系统检测。通过质谱分析,鉴定出100种在癌组织与非癌组织中表达存在显著差异的蛋白质。研究进一步通过实时定量RT-PCR、免疫印迹和免疫组织化学方法对差异蛋白S100A2、KRT16、FGB和HSPB1进行了验证。此外,通过RNA干扰技术对高表达蛋白S100钙结合蛋白A2(S100A2)进行了功能分析,发现抑制S100A2表达可增强HEp-2细胞系的体外迁移和侵袭能力。该数据集为理解喉癌的发病机制、寻找潜在治疗靶点以及开发新型抗癌药物提供了重要的蛋白质组学数据支持。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://search.dataone.org/view/null
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对喉癌(头颈部最常见的鳞状细胞癌)的蛋白质组学数据集。研究采用iTRAQ(等重同位素标记相对和绝对定量)技术和质谱分析,对15对喉癌组织与癌旁正常组织样本的蛋白质表达差异进行了系统检测。通过质谱分析,鉴定出100种在癌组织与非癌组织中表达存在显著差异的蛋白质。研究进一步通过实时定量RT-PCR、免疫印迹和免疫组织化学方法对差异蛋白S100A2、KRT16、FGB和HSPB1进行了验证。此外,通过RNA干扰技术对高表达蛋白S100钙结合蛋白A2(S100A2)进行了功能分析,发现抑制S100A2表达可增强HEp-2细胞系的体外迁移和侵袭能力。该数据集为理解喉癌的发病机制、寻找潜在治疗靶点以及开发新型抗癌药物提供了重要的蛋白质组学数据支持。
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