Td 多物种相互作用
该数据集来自 omicsdi.org，属于口颌系统疾病下的其他类别，主题标签为 Transcriptomics。研究以 T. denticola 作为红色复合体模式微生物，将其分别与 P. intermedia、S. sanguinis、S. gordonii、F. nucleatum、P. gin
基本信息
资源简介
Td 多物种相互作用
该数据集来自 omicsdi.org，属于口颌系统疾病下的其他类别，主题标签为 Transcriptomics。研究以 T. denticola 作为红色复合体模式微生物，将其分别与 P. intermedia、S. sanguinis、S. gordonii、F. nucleatum、P. gingivalis 或 T. forsythia 混合培养，经离心诱导细胞接触后提取 RNA，利用微阵列鉴定差异调控基因的数量与类型，用于分析红色复合体微生物在细胞接触时的相互响应及相关基因（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们利用 T. denticola 作为红色复合体模式微生物，以帮助确定红色复合体微生物在混合培养中细胞与细胞接触时是否能够相互响应，以及参与此类响应的基因类型。我们从 T. denticola 与经离心诱导细胞接触的其他 P. intermedia、S. sanguinis、S. gordonii、F. nucleatum、P. gingivalis 或 T. forsythia 的组合中提取 RNA，并使用微阵列鉴定差异调控基因的数量和类型。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：口颌系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-3059
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-3059
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们利用齿垢密螺旋体作为红色复合体微生物的模型，以帮助确定红色复合体微生物在混合培养中细胞与细胞接触时是否能相互响应，以及参与此类响应的基因类型。我们从齿垢密螺旋体与中间普雷沃菌、血链球菌、戈登链球菌、具核梭杆菌、牙龈卟啉单胞菌或福赛斯坦纳菌的组合中提取RNA，这些组合经过离心以诱导细胞接触，并使用微阵列技术鉴定出差异调控基因的数量和类型。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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