颅面与牙科遗传学中心(CCDG):口面裂、亚型及亚临床表型的遗传学研究 - CIDR

BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物数据,源自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供一个单一入口,以查找为该计划生成的各种数据类型相关的链接

sra
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其他分类口腔疾病口面裂遗传学亚临床表型BioProjectCCDG
PRJNA807787: Center for Craniofacial and Dental Genetics (CCDG): Genetics of Orofacial Clefts, Sub-types, and Subclinical Phenotypes - CIDR

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

颅面与牙科遗传学中心(CCDG):口面裂、亚型及亚临床表型的遗传学研究 - CIDR

PRJNA807787 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物研究计划记录,其完整英文名称为“Center for Craniofacial and Dental Genetics (CCDG): Genetics of Orofacial Clefts, Sub-types, and Subclinical Phenotypes - CIDR”。该记录围绕颅面与牙科遗传学中心(CCDG)发起的研究计划组织,聚焦于口面部裂、其亚型以及亚临床表型的遗传学研究,并关联 CIDR 相关数据。BioProject 作为生物数据的集合,源自单一组织或联盟,旨在为用户提供单一入口,以便查找该研究计划所产生的多种数据类型及其相关链接。本站将其归入口腔疾病 / 其他分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

该数据集对应一项由颅面与牙科遗传学中心(CCDG)发起的研究计划,主题为口面部裂、其亚型以及亚临床表型的遗传学,并带有 CIDR 标识。BioProject 的设计初衷是汇集与单一研究计划相关的生物数据,这些数据可来自单一组织或联盟。通过 BioProject 记录,用户可以集中获取该计划所生成的不同数据类型之间的链接,而不必在多个分散的资源中逐一查找。该记录的名称和来源标题均指向 CCDG 与 CIDR 相关的研究工作,本站分类将其置于口腔疾病 / 其他类别之下。

【数据内容】

该 BioProject 记录本身是生物数据的集合入口,用于关联和索引由该研究计划产生的多种数据类型。源站描述指出,BioProject 记录为用户提供一个单一入口,以查找为该计划生成的各种数据类型相关的链接。因此,该数据集的内容并非单一类型的数据文件,而是围绕“口面部裂、亚型及亚临床表型的遗传学”这一研究计划所组织的数据链接集合。具体包含哪些数据类型、样本数量、表型字段或遗传标记等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录标识为 BioProject ID 807787。其源站标题显示为“Center for Craniofacial and Dental Genetics (CCDG)... (ID 807787) - BioProject - NCBI”。BioProject 记录通常源自单一组织或联盟,本记录对应的是颅面与牙科遗传学中心(CCDG)相关的研究计划,并涉及 CIDR。关于样本采集方式、采集地点、采集时间、纳入排除标准等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要查找或关联“口面部裂、其亚型以及亚临床表型的遗传学”研究计划相关数据的用户。由于 BioProject 提供单一入口来查找该计划生成的各种数据类型链接,它可用于了解该研究计划下有哪些数据资源可供访问,并作为进一步获取原始数据或分析结果的起点。其本站分类为口腔疾病 / 其他,因此也可能适用于口腔疾病相关研究背景下的数据检索与资源定位。具体分析场景、研究设计用途等,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录(ID 807787)访问该研究计划的入口页面,并借助其中提供的链接查找为该计划生成的各种数据类型。BioProject 记录的作用是集中呈现与单一研究计划相关的数据链接,因此使用方法以检索、导航和关联为主。关于如何下载具体数据、是否需要申请权限、是否有 API 或批量获取方式等,源站未提供。

【质量与限制】

该记录为 BioProject 条目,其描述强调 BioProject 是相关生物数据的集合,并源自单一组织或联盟。就本记录而言,关于数据质量评估、完整性、准确性、更新频率、版本控制以及使用限制等信息,源站未提供。用户在使用时应注意,BioProject 记录本身主要是入口和链接集合,具体数据质量需依据所链接的各个数据资源来判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用格式、许可条款、使用协议或版权声明,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA807787

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目的目的是识别导致非综合征性口面裂(OFCs)、常见亚型及相关亚临床表型的遗传因素。OFCs最常见的亚型为单纯唇裂(CL)、唇裂伴腭裂(CLP)和单纯腭裂(CP)。CL和CLP可为单侧(左侧或右侧)或双侧。相关的亚临床表型包括隐性唇部肌肉缺陷、颅面形态特征及细微言语异常,这些表型分布于患者家系中,可能反映了潜在的遗传易感性,为揭示OFC病因提供线索。该多族裔数据集包含从宾夕法尼亚州、波多黎各、哥伦比亚、菲律宾、尼日利亚和加纳招募的参与者,并包括……(更多内容见dbGaP研究页面。)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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