phs000440:CCDG:危地马拉的龋齿与CL/P

数据覆盖危地马拉的龋齿与 CL/P 相关研究,以核心家庭为对象,可用于口腔疾病遗传学与家庭聚集性分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Nuclear Families
phs000440: CCDG: Dental Caries and CL/P in Guatemala

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

phs000440:CCDG:危地马拉的龋齿与CL/P

phs000440: CCDG: Dental Caries and CL/P in Guatemala 是一个以核心家庭为研究单位的遗传学研究数据集,聚焦危地马拉人群中的龋齿与唇腭裂(CL/P)问题。该数据集来源于 NCBI 的 dbGaP 数据库,属于口腔疾病 / 其他分类。其核心价值在于为口腔疾病的遗传学研究和家庭聚集性分析提供基础数据,帮助研究者探索龋齿与唇腭裂在核心家庭中的分布特征及潜在遗传因素。数据集以核家庭为对象,意味着数据可能涉及父母与子女的生物学关系信息,从而支持亲子传递、连锁分析或家族风险评价等研究设计。整体而言,该数据集是口腔疾病遗传流行病学领域的一个专门资源,适用于对危地马拉人群特定口腔表型进行深入遗传分析的研究场景。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI 的 dbGaP 研究数据库,研究主题为危地马拉地区的龋齿与唇腭裂(CL/P)。龋齿和唇腭裂是两种常见的口腔及颅面发育异常,前者属于感染性、行为与遗传因素共同作用的慢性口腔疾病,后者则是出生缺陷中较常见的一类。将两者置于同一研究框架下,并以核心家庭为对象,表明该研究可能关注这些疾病在家庭内的共现模式、遗传易感性以及可能的共享生物学通路。数据集所属分类为口腔疾病 / 其他,说明其内容不局限于某一类典型口腔疾病,而是涵盖更广泛的口腔健康相关表型。源站描述仅指出其为 dbGaP 研究(核家庭),未提供更详细的研究背景、资助信息或研究假设。

【数据内容】

该数据集以核心家庭为基本单位,主题标签为“Nuclear Families”。这意味着数据组织方式围绕家庭结构展开,可能包含家庭成员之间的遗传关系信息以及相应的口腔表型数据。具体而言,龋齿和唇腭裂是数据集关注的两类主要表型,但源站未提供具体的变量列表、样本量、表型测量方法、基因分型平台或遗传标记信息。数据覆盖危地马拉人群,这一地理和人群背景对于研究特定人群中的等位基因频率、疾病易感性差异以及家庭聚集性具有重要意义。由于数据集属于 dbGaP 研究,通常可能包含去标识化的个体级数据,但源站未提供数据文件格式、字段结构或访问级别的具体说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体属于 dbGaP 数据库中的研究条目。源站描述仅注明其为“dbGaP study (Nuclear Families)”,未提供样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批信息或数据提交机构等细节。可以确定的是,数据采集对象为危地马拉的核心家庭,研究内容涉及龋齿与唇腭裂。由于 dbGaP 是美国国家生物技术信息中心管理的基因型与表型数据库,该数据集很可能遵循 dbGaP 的数据提交和共享规范,但源站未提供具体的采集流程、样本处理或质量控制方法。

【适用场景】

该数据集适用于口腔疾病遗传学与家庭聚集性分析。具体而言,研究者可以利用核心家庭结构进行遗传连锁分析、关联研究或传递不平衡检验,以探索龋齿和唇腭裂的遗传基础。此外,由于数据覆盖危地马拉人群,它也可用于比较不同人群间口腔疾病遗传易感性的差异,或研究家庭环境与遗传因素在疾病发生中的交互作用。对于关注唇腭裂与龋齿共病机制的研究者,该数据集可能提供有价值的家庭级表型与遗传数据。然而,源站未提供具体的研究设计类型、样本量或统计功效信息,因此适用场景的详细程度受限于现有描述。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据访问申请流程、下载格式、分析工具或推荐的分析流程。通常 dbGaP 数据集需要通过受控访问申请,但源站未说明该数据集是否属于开放访问或受控访问。研究者若需使用该数据集,应参考 dbGaP 的通用数据访问政策,但具体到本数据集的申请条件、审批时间或使用限制,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量控制指标、缺失率、样本排除标准或数据完整性信息。已知的限制包括:数据集仅覆盖危地马拉人群,结果外推到其他人群时需谨慎;研究聚焦于龋齿和唇腭裂,可能不适用于其他口腔疾病;核心家庭设计虽然有利于遗传分析,但可能无法充分解析复杂环境暴露的影响。此外,源站未提供样本量、统计功效或验证结果,因此无法评估该数据集在特定分析中的可靠性。所有关于质量与限制的判断均需基于源站未提供这一事实,不能进行推测。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款。通常 dbGaP 研究要求用户在发表成果时引用相应的 dbGaP 登录号和研究论文,但本数据集的具体引用要求、数据使用协议或版权信息,源站未提供。研究者应直接查阅 ncbi.nlm.nih.gov 上该数据集的官方页面以获取最新的引用与许可信息。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000440

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Nuclear Families).

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