神经嵴特异性Alx1条件敲除小鼠胚胎第13.5天上颌切牙组织转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336212

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

牙齿形态发生依赖于牙上皮与神经嵴来源间充质之间的相互作用。ALX1是一种成对样同源域转录因子，与颅面发育有关，但其在牙齿发育过程中的分子功能仍知之甚少。为研究早期牙发育中Alx1缺失相关的转录变化，我们对从胚胎第13.5天（E13.5）神经嵴特异性Alx1条件性敲除小鼠（Wnt1-Cre;Alx1 flox/flox）及其同窝野生型对照中分离的上颌切牙组织进行了bulk RNA测序。该数据集为鉴定Alx1在早期上颌切牙发育过程中调控的基因和信号通路提供了全面的转录组资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。