Charcot-Marie-Tooth (CMT) 遗传学:CMT1A 修饰因子与 CMT2 新病因
项目旨在理解修饰基因如何影响疾病表达严重程度,并识别尚未明确遗传学病因的新 CMT 类型。受试者血液样本送至 University of Miami 进行编码接收与外显子测序,参与为可选

基本信息
资源简介
Charcot-Marie-Tooth (CMT) 遗传学:CMT1A 修饰因子与 CMT2 新病因
该数据集英文名为 Genetics of Charcot Marie Tooth (CMT) - Modifiers of CMT1A, New Causes of CMT2,来源于 clinicaltrials.gov,在本站归入口腔疾病 / 其他分类。其主题标签为 Charcot-Marie-Tooth Disease, Type Ia (Disorder) 与 HMSN。项目关注两个相互关联的方向:一是理解修饰基因及其对疾病表达严重程度的影响,二是识别尚未明确遗传学病因的新 CMT 类型。符合条件的受试者要么患有 CMT1A,要么属于未知类型的 CMT;血液样本将被送至 University of Miami,由其编码接收并进行外显子测序,受试者会被告知参与属于可选事项。整体而言,该数据集围绕遗传学层面的疾病修饰机制与新病因发现而组织,涉及临床受试者信息与生物样本检测流程,适合用于理解 CMT 相关遗传研究的对象界定、样本流转与测序环节。
【数据集背景】
该数据集对应的项目聚焦于 Charcot-Marie-Tooth 病(CMT)的遗传学问题。源站描述指出,项目的研究目标包括理解修饰基因以及这些基因如何影响疾病表达的严重程度,同时还包括识别那些尚未在遗传学上被确定的新 CMT 形式。数据集涉及的疾病条件包括 Charcot-Marie-Tooth Disease, Type Ia (Disorder) 与 HMSN,主题标签同样指向这两个概念。从研究设计看,项目同时覆盖已知类型的 CMT1A 与未知类型的 CMT,前者用于探讨修饰基因对疾病严重程度的影响,后者用于寻找新的遗传学病因。这一背景决定了数据集在内容上会涉及受试者的疾病分型信息以及用于遗传学分析的生物样本。
【数据内容】
依据源站描述,该数据集涉及的信息围绕符合条件的受试者展开:受试者要么患有 CMT 1A(CMT1A),要么患有未知形式的 CMT。项目会采集血液样本,样本被送至 University of Miami,在那里被编码接收并经过外显子测序处理。受试者会被告知参与是可选事项。除上述内容外,关于数据集的具体字段构成、样本数量、测序数据规模、变量列表等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 clinicaltrials.gov。采集方式体现为对符合条件受试者的血液样本进行采集,并将样本送至 University of Miami;该机构对样本进行编码接收,并开展外显子测序。源站描述明确说明受试者会被告知参与为可选。关于采集时间窗口、采集地点分布、样本运输与保存的具体条件、编码规则等技术细节,源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述,该数据集可用于理解 CMT1A 中修饰基因与疾病表达严重程度之间关系的研究场景,也可用于识别尚未明确遗传学病因的新 CMT 类型的探索性场景。由于涉及血液样本的外显子测序流程,其内容与遗传学分析、疾病分型研究以及生物样本编码管理等环节相关。关于该数据集在其他具体研究、临床或教学场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
源站描述提及的流程为:符合条件的受试者提供血液样本,样本送至 University of Miami,由其编码接收并处理外显子测序;受试者被告知参与为可选。关于数据获取方式、访问权限、分析工具、数据处理步骤或使用协议等具体使用方法,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述说明参与为可选,且样本经过编码处理并由 University of Miami 接收与测序,这些信息反映了项目在样本处理与受试者知情方面的安排。关于数据质量指标、样本量、测序覆盖度、数据完整性、偏倚控制或验证结果等质量相关信息,源站未提供。该数据集在本站分类为口腔疾病 / 其他,而源站描述聚焦于 CMT 与 HMSN 的遗传学研究,分类与内容主题之间的对应关系源站未提供进一步说明。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT01193088
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:腓骨肌萎缩症Ia型(疾病),遗传性运动感觉神经病。本项目旨在了解修饰基因及其如何影响疾病表现的严重程度,同时鉴定尚未通过遗传学确定的CMT新类型。符合条件的研究对象要么患有CMT 1A型(CMT1A),要么患有未知类型的CMT。将采集血液样本并送至迈阿密大学,由其接收编码样本并进行外显子组测序处理。研究对象将被告知此项检测为自愿选择。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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