Tabernanthe iboga 中 ibogaine 生物合成末端步骤的细胞色素 P450 与 O-甲基转移酶数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.2mh70m2

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 3.91 GB。

数据说明

单萜吲哚生物碱（MIAs）是一大类（约3000种）结构多样的代谢产物，仅限于龙胆目中的少数植物科。非洲象牙木或伊博格（夹竹桃科）原产于非洲西部赤道地区，几个世纪以来一直用于传统医学。霍华德·洛索夫因偶然发现伊博格能缓解阿片戒断症状，而将伊博格引入西方医学的视野。自这一观察以来，伊博格在成瘾的一般管理中的应用得到了研究。我们感兴趣的是阐明伊博格因的生物合成，以了解通往伊博格因的独特反应步骤。此外，由于伊博格因目前来源于植物材料，这些研究可能有助于通过合成生物学方法改善伊博格因的供应链。

在此，我们利用下一代测序技术生成了首个伊博格转录组，并借助同源引导的基因发现方法，鉴定出伊博格碱生物合成途径中的倒数第二个羟化酶和最后一个O-甲基转移酶步骤，分别命名为伊博格胺10-羟化酶（I10H）和去甲伊博格碱10-O-甲基转移酶（N10OMT）。通过在酿酒酵母（I10H）或大肠杆菌（N10OMT）中异源表达，并与假定前体共孵育，结合HPLC-MS分析，证实了这两种酶的预期活性。此外，在积累伊博格碱的植物组织中检测到其转录本的高表达水平。这些发现连同我们公开的伊博格转录组，将促进更多基因发现工作，并可能有助于稳定全球伊博格碱供应链，以及推动伊博格碱作为成瘾治疗药物的发展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。