TET-Sall4-BMP调控轴控制颅面软骨发育数据集
该数据集来自 Mendeley Data,围绕 TET-Sall4-BMP 调控轴控制颅面软骨发育的研究,包含 239 个文件,涉及斑马鱼胚胎咽软骨发育、单细胞 RNA 测序、5hmC DNA IP qPCR 及 5hmC 水平检测等实验数据

基本信息
资源简介
TET-Sall4-BMP调控轴控制颅面软骨发育数据集
The TET-Sall4-BMP regulatory axis controls craniofacial cartilage development
该数据集来自 Mendeley Data,围绕 TET-Sall4-BMP 调控轴控制颅面软骨发育的研究,包含 239 个文件,涉及斑马鱼胚胎咽软骨发育、单细胞 RNA 测序、5hmC DNA IP qPCR 及 5hmC 水平检测等实验数据。数据覆盖半面短小症(CFM)相关分子机制探索,可用于研究 Tet2/3 缺失对软骨细胞分化的影响、Sall4 与 bmp4 启动子结合及相分离介导 5mC 氧化的调控过程,为口颌系统疾病尤其是半面短小症的致病机制提供数据支撑(来源 Mendeley Data)。
【数据集背景】
源站首次发布:2024-02-05。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):颅面短小症(CFM)是一种先天性缺陷,通常由胚胎咽弓发育异常引起。然而,CFM 发病机制的分子基础在很大程度上仍不清楚。在此,我们采用斑马鱼模型研究 CFM 发病机制。在早期胚胎中,tet2 和 tet3 对咽软骨发育至关重要。单细胞 RNA 测序揭示,Tet2/3 缺失因 BMP 信号不足而损害软骨细胞分化。此外,生化和遗传学证据表明,序列特异性 5mC/5hmC 结合蛋白 Sall4 结合 bmp4 的启动子以激活 bmp4 表达并控制咽软骨发育。在机制上,Sall4 引导 Tet2/3 与 Sall4 共相分离形成凝聚物,介导 bmp4 启动子上的 5mC 氧化,从而促进 bmp4 表达并使 suffi
【数据结构与技术规格】
文件数 239 个,合计 2.27 GB。数据集 DOI:10.17632/cbchtm2z37.1。
【主题与分类】
主题标签:口颌系统疾病、半面短小症、颅面软骨发育、斑马鱼模型、单细胞RNA测序、BMP信号通路、5mC/5hmC氧化。本站分类:口颌系统疾病/半面短小症。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/cbchtm2z37
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/cbchtm2z37
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.27 GB。
数据说明
Liangliang Wang (2024). The TET-Sall4-BMP regulatory axis controls craniofacial cartilage development [Dataset]. http://doi.org/10.17632/cbchtm2z37.1
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