TGF-β3处理或Tgfb3敲低后小鼠腭上皮细胞RNA测序数据集
该数据集来自NCBI,包含胚胎第15天C57BL6/J小鼠腭上皮细胞的RNA测序数据,分为对照组、1 ng/mL重组TGF-β3处理诱导EMT组和siRNA转染Tgfb3敲低组

基本信息
资源简介
TGF-β3处理或Tgfb3敲低后小鼠腭上皮细胞RNA测序数据集
RNA sequencing of mouse palatal epithelial cells following TGF-β3 treatment or Tgfb3 knockdown
该数据集来自NCBI,包含胚胎第15天C57BL6/J小鼠腭上皮细胞的RNA测序数据,分为对照组、1 ng/mL重组TGF-β3处理诱导EMT组和siRNA转染Tgfb3敲低组。数据提供TGF-β3介导腭融合过程中的全局基因表达谱,可用于研究上皮-间充质转化在腭发育中的调控机制及唇腭裂相关通路(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):内侧边缘上皮细胞的上皮-间充质转化(EMT)是胚胎腭融合的关键机制,由转化生长因子β3(TGF-β3)驱动。然而,其与下游级联的调控相互作用仍知之甚少。为阐明腭发生过程中的细胞重编程机制,分离了胚胎第15天C57BL6/J小鼠腭上皮细胞以消除间充质干扰。为评估转录组变化,对三组培养细胞进行了下一代RNA测序:对照组(未处理)、用1 ng/mL重组TGF-β3处理以诱导EMT的组、以及siRNA转染Tgfb3敲低组。该数据集提供了TGF-β3介导腭融合的全局基因表达谱,揭示EMT为主要通路。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:口颌系统疾病/唇裂和腭裂。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343560
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 11 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
胚胎腭中嵴上皮细胞的上皮-间充质转化(EMT)是胚胎腭融合的关键机制,由转化生长因子β3(TGF-β3)驱动。然而,其与下游级联反应的调控相互作用仍知之甚少。为阐明腭发生过程中的细胞重编程机制,分离了胚胎第15天C57BL6/J小鼠腭上皮细胞以消除间充质干扰。为评估转录组变化,对三组培养细胞进行了下一代RNA测序:对照组(未处理)、用1 ng/mL重组TGF-β3处理以诱导EMT的组,以及siRNA转染敲低Tgfb3的组。该数据集提供了TGF-β3介导的腭融合所涉及的全局基因表达谱,揭示EMT为主要通路。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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