LPS刺激的人单核细胞衍生巨噬细胞基因表达（3D-MO）
该数据集来自omicsdi.org，包含人单核细胞衍生巨噬细胞的RNA-seq数据。样本接受靶向RAD21的siRNA处理，并分为未处理或LPS刺激两种条件，共24个样本
基本信息
资源简介
LPS刺激的人单核细胞衍生巨噬细胞基因表达（3D-MO）
该数据集收录的是人单核细胞衍生巨噬细胞的RNA-seq数据，英文名称为Gene expression in LPS-stimulated human monocyte-derived macrophages (3D-MO)。样本在接受靶向RAD21的siRNA处理后，被分为未处理与LPS刺激两种条件，共计24个样本。从主题上看，该数据集属于转录组学范畴，可用于观察在上述处理条件下巨噬细胞基因表达的变化情况。数据集来源于omicsdi.org，在分类上被归入口颌系统疾病下的唇裂和腭裂方向。整体而言，该数据集围绕RAD21敲低与LPS刺激两个变量，提供了人单核细胞衍生巨噬细胞的转录组数据，适合用于相关基因表达研究。
【数据集背景】
该数据集关注的是人单核细胞衍生巨噬细胞在特定干预条件下的基因表达情况。巨噬细胞是免疫反应中的重要细胞类型，LPS刺激常用于模拟炎症或免疫激活状态。该数据集通过siRNA技术靶向RAD21，并设置未处理与LPS刺激两种条件，旨在为研究RAD21在巨噬细胞转录调控中的作用提供数据基础。数据集被归入口颌系统疾病 / 唇裂和腭裂分类，但源站描述中未进一步说明该分类与数据内容之间的具体关联。
【数据内容】
该数据集由RNA-seq数据构成，样本为人单核细胞衍生巨噬细胞。所有样本均接受靶向RAD21的siRNA处理，随后分为两组：一组保持未处理状态，另一组接受LPS刺激。数据集共包含24个样本。主题标签为Transcriptomics，表明其核心内容为转录组层面的基因表达信息。源站未提供具体的基因列表、表达矩阵、测序深度、读长、比对率等细节。
【采集与来源】
数据集来源于omicsdi.org。源站描述说明，该数据集由人单核细胞衍生巨噬细胞的RNA-seq数据组成，样本经过靶向RAD21的siRNA处理，并处于未处理或LPS刺激两种条件之一。除上述信息外，源站未提供样本采集地点、时间、伦理审批信息、测序平台或建库方法等具体采集细节。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关分析，尤其是围绕人单核细胞衍生巨噬细胞在RAD21敲低及LPS刺激条件下基因表达变化的研究。潜在应用包括差异表达分析、通路富集分析以及免疫相关基因调控研究。由于数据集被归入口颌系统疾病 / 唇裂和腭裂分类，也可能被用于该分类下的探索性分析，但源站未提供该分类与数据内容之间直接关联的说明。
【使用方法】
使用者可根据源站提供的RNA-seq数据，对24个样本进行分组比较，例如比较未处理与LPS刺激条件下的表达差异，或评估RAD21 siRNA处理带来的转录组变化。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程和软件建议，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集共24个样本，样本量有限，可能影响统计效力。源站未提供测序质量、重复次数、批次效应、归一化方法或验证实验等信息。此外，数据集分类为口颌系统疾病 / 唇裂和腭裂，但源站描述未解释该分类依据，因此在使用时需注意分类与数据内容之间可能存在的差异。其他质量相关指标，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权信息。使用者如需引用或使用该数据集，应自行查阅omicsdi.org上的原始页面以获取相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10845
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自人单核细胞衍生巨噬细胞的RNA-seq数据，这些细胞接受了靶向RAD21的siRNA处理，并且要么未受刺激，要么用LPS刺激。总共包括24个样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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