利用人类干细胞模拟结节性硬化症神经病理学揭示炎症与血管生成生长因子的作用[细胞模型]

Name: 利用人类干细胞模拟结节性硬化症神经病理学揭示炎症与血管生成生长因子的作用[细胞模型]
Creator: F. Hoffmann-La Roche
License: openSource

该数据集基于人类干细胞模型，包含TSC2缺陷神经干细胞的功能成熟度、转录组和核糖体图谱等多模态分子数据，揭示了结节性硬化症神经病理学中炎症反应与血管生成生长因子的关键作用，主要用于研究mTOR相关神经疾病的分子机制和开发靶向治疗策略。

F. Hoffmann-La Roche

干细胞与再生医学数据中心

2022-02-20 更新

AstrocytesStem cell disease modelingTSC2Tuberous sclerosismTOR.人Neurons转录组

Modeling the Neuropathology of Tuberous Sclerosis with Human Stem Cells Reveals a Role for Inflammation and Angiogenic Growth Factors [Cell Model]

基本信息

许可

openSource

创建/更新时间

2022-02-20

资源简介

利用人类干细胞模拟结节性硬化症神经病理学揭示炎症与血管生成生长因子的作用[细胞模型]

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Modeling the Neuropathology of Tuberous Sclerosis with Human Stem Cells Reveals a Role for Inflammation and Angiogenic Growth Factors [Cell Model]》。源站首次发布：2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述：Tuberous sclerosis complex (TSC) is a rare genetic disease characterized by mTOR hyperfunction induced benign tumor growths in multiple organs and neurological symptoms. Because the molecular pathology is highly complex and the etiology poorly understood we employed a defined human neuronal model with a single mTOR activating mutation to dissect the disease-relevant molecular responses driving the neuropathology. TSC2 deficient neural stem cells showed severely reduced neuronal functional matura…

【主题与分类】

主题标签：Astrocytes、Stem cell disease modeling、TSC2、Tuberous sclerosis、mTOR.、Astrocytes、Stem cell disease modeling、TSC2、Tuberous sclerosis、mTOR.。

【获取与许可】

源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=cfa48bcddabc30c3739a20fbb9830bc3

使用许可：openSource。

规范引用：PMID: 27655340

原始链接

http://data.iscr.ac.cn/Article?id=cfa48bcddabc30c3739a20fbb9830bc3

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源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=cfa48bcddabc30c3739a20fbb9830bc3

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- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集基于人类干细胞模型，研究结节性硬化症（TSC）的神经病理学机制。数据包含TSC2基因缺陷的神经干细胞在功能成熟、转录组、核糖体图谱等方面的实验观测结果，揭示了mTOR通路异常导致的炎症反应、代谢活性增加、核糖体转录过度以及血管生成生长因子合成增强等分子变化。数据来源于体外构建的携带单一mTOR激活突变的人类神经元模型，通过高通量测序和功能分析获得。主要应用于神经退行性疾病机制探索、药物靶点发现以及个体化治疗策略开发。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别