小鼠结膜上皮细胞基因调控网络分析揭示史蒂文斯-约翰逊综合征相关串扰介质
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE307435,聚焦史蒂文斯-约翰逊综合征(SJS)相关机制。研究以小鼠结膜上皮细胞为对象,通过基因表达谱芯片和基因调控网络分析,探讨 Ikzf1、Ptger3、Mavs 与 Tlr3 通路之间的串扰机制

基本信息
资源简介
小鼠结膜上皮细胞基因调控网络分析揭示史蒂文斯-约翰逊综合征相关串扰介质
Crosstalk mediators implicated in Stevens-Johnson syndrome through gene regulatory network analysis of murine conjunctival epithelial cells
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE307435,聚焦史蒂文斯-约翰逊综合征(SJS)相关机制。研究以小鼠结膜上皮细胞为对象,通过基因表达谱芯片和基因调控网络分析,探讨 Ikzf1、Ptger3、Mavs 与 Tlr3 通路之间的串扰机制。数据包含 1 个文件(GSE307435_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL6246 和小鼠物种(10090)。该数据可用于 SJS 相关基因表达模式分析与调控网络研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在阐明结膜上皮细胞中 Ikzf1、Ptger3、Mavs 和 Tlr3 通路之间的串扰机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6246、10090。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/史蒂文斯-约翰逊综合征。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307435
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在阐明结膜上皮细胞中Ikzf1、Ptger3、Mavs和Tlr3通路之间的交叉对话机制。采用Affymetrix GeneChip Mouse Gene 1.0 ST芯片在16种条件下(野生型、基因敲除和转基因背景,伴或不伴polyI:C刺激)进行全基因组表达谱分析。对所得数据进行分析,以识别连接四个关键调控因子与干扰素刺激基因的候选介导因子。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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