小鼠结膜上皮细胞基因调控网络分析揭示史蒂文斯-约翰逊综合征相关串扰介质

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE307435,聚焦史蒂文斯-约翰逊综合征(SJS)相关机制。研究以小鼠结膜上皮细胞为对象,通过基因表达谱芯片和基因调控网络分析,探讨 Ikzf1、Ptger3、Mavs 与 Tlr3 通路之间的串扰机制

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL624610090
GSE307435: Crosstalk mediators implicated in Stevens-Johnson syndrome through gene regulatory network analysis of murine conjunctival epithelial cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

小鼠结膜上皮细胞基因调控网络分析揭示史蒂文斯-约翰逊综合征相关串扰介质

Crosstalk mediators implicated in Stevens-Johnson syndrome through gene regulatory network analysis of murine conjunctival epithelial cells

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE307435,聚焦史蒂文斯-约翰逊综合征(SJS)相关机制。研究以小鼠结膜上皮细胞为对象,通过基因表达谱芯片和基因调控网络分析,探讨 Ikzf1、Ptger3、Mavs 与 Tlr3 通路之间的串扰机制。数据包含 1 个文件(GSE307435_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL6246 和小鼠物种(10090)。该数据可用于 SJS 相关基因表达模式分析与调控网络研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 09 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在阐明结膜上皮细胞中 Ikzf1、Ptger3、Mavs 和 Tlr3 通路之间的串扰机制。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL6246、10090。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/史蒂文斯-约翰逊综合征。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307435

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在阐明结膜上皮细胞中Ikzf1、Ptger3、Mavs和Tlr3通路之间的交叉对话机制。采用Affymetrix GeneChip Mouse Gene 1.0 ST芯片在16种条件下(野生型、基因敲除和转基因背景,伴或不伴polyI:C刺激)进行全基因组表达谱分析。对所得数据进行分析,以识别连接四个关键调控因子与干扰素刺激基因的候选介导因子。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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