皮肤红斑狼疮皮损与正常皮肤中GAG糖基因表达研究
该数据集来自ebi.ac.uk，主题为转录组芯片表达谱，物种为Homo sapiens，属于皮肤疾病分类。研究聚焦皮肤红斑狼疮（CLE）皮损与正常皮肤中糖胺聚糖（GAG）相关糖基因的表达，旨在比较CLE患者皮损、非皮损皮肤与健康对照之间GAG合成、降解及修饰基因的表达谱差异，以探索CLE皮损中GAG
基本信息
资源简介
皮肤红斑狼疮皮损与正常皮肤中GAG糖基因表达研究
To study glycosaminoglycan (GAG) glycogene expression in cutaneous lupus erythematosus (CLE) skin lesions and normal skin
该数据集来自ebi.ac.uk，主题为转录组芯片表达谱，物种为Homo sapiens，属于皮肤疾病分类。研究聚焦皮肤红斑狼疮（CLE）皮损与正常皮肤中糖胺聚糖（GAG）相关糖基因的表达，旨在比较CLE患者皮损、非皮损皮肤与健康对照之间GAG合成、降解及修饰基因的表达谱差异，以探索CLE皮损中GAG升高及局部炎症的分子基础。数据可用于分析CLE相关基因表达变化、筛选差异表达基因，并支持皮肤自身免疫疾病分子机制研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：皮肤红斑狼疮（CLE）是一种局限于皮肤的自身免疫性疾病，已知其皮肤活检标本的Hale染色显示糖胺聚糖（GAG）升高。近年来，不同种类的GAG已被证明对免疫细胞的募集和激活以及细胞因子产生的刺激具有不同作用（Taylor and Gallo, FASEB, 2006; 20: 9-22）。因此，我们推测在CLE中观察到的GAG升高在这些患者产生皮肤病变的局部炎症过程中发挥作用。为了进一步研究CLE皮肤病变中这些GAG表达升高的分子基础，我们希望确定CLE患者皮损和非皮损皮肤样本中GAG合成、降解和修饰基因的基因表达谱，并与健康对照进行比较。微阵列方法将为我们提供
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类：皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-29938
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
Steven Head; Victoria Werth (2011). To study glycosaminoglycan (GAG) glycogene expression in cutaneous lupus erythematosus (CLE) skin lesions and normal skin [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-29938
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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