铜绿假单胞菌来源神经酰胺酶经Sphingosine-1-Phosphate诱导人角质形成细胞产生炎症介质
研究从一位特应性皮炎患者中分离出铜绿假单胞菌来源的中性神经酰胺酶（PaCDase），在金黄色葡萄球菌来源脂质或中性去污剂存在下可有效降解神经酰胺
基本信息
资源简介
铜绿假单胞菌来源神经酰胺酶经Sphingosine-1-Phosphate诱导人角质形成细胞产生炎症介质
该数据集来自 omicsdi.org，属于皮肤疾病/其他分类，主题为 Transcriptomics。研究从一位特应性皮炎患者中分离出铜绿假单胞菌来源的中性神经酰胺酶（PaCDase），在金黄色葡萄球菌来源脂质或中性去污剂存在下可有效降解神经酰胺。为理解神经酰胺代谢物对分化中角质形成细胞功能的影响，研究对经 PaCDase、sphingosine-1-phosphate（S1P）处理或未处理的三维培养人原代角质形成细胞进行基因表达分析，细胞在 Triton X-100 存在下形成角质层，使用高分辨率 DNA microarray。数据可用于分析 PaCDase 与 S1P 对皮肤角质形成细胞炎症相关基因表达的影响（来源 omicsd。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：从一位特应性皮炎患者中分离出的铜绿假单胞菌来源中性神经酰胺酶（PaCDase）被证明在金黄色葡萄球菌来源脂质或中性去污剂存在下能有效降解神经酰胺。为理解神经酰胺代谢物对分化中角质形成细胞功能的影响，我们在 Triton X-100 存在下，使用高分辨率 DNA microarray 对经 PaCDase、sphingosine-1-phosphate（S1P）处理或未处理的三维培养人原代角质形成细胞（其形成角质层）进行了基因表达分析。为评估 PaCDase 和 S1P 对角质形成细胞功能的影响，我们按照 Spiekstra 等人 [25] 的方法并作一些修改，在角质形成细胞无血清培养基（keratinocyte-SFM）（Invitrogen；Carlsbad，CA，USA）中对 EPI-Model 进行了表皮 24 小时斑贴试验。Triton X-100 处理的
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-53670
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
从特应性皮炎患者中分离出的一种铜绿假单胞菌来源的中性神经酰胺酶（PaCDase），在金黄色葡萄球菌来源的脂质或中性去垢剂存在下，能够有效降解神经酰胺。为了解神经酰胺代谢产物对分化中角质形成细胞功能的影响，我们在Triton X-100存在下，利用高分辨率DNA微阵列，对经PaCDase、1-磷酸鞘氨醇（S1P）处理或未处理的三维培养人原代角质形成细胞（可形成角质层）进行了基因表达分析。为评估PaCDase和S1P对角质形成细胞功能的影响，我们参照Spiekstra等人[25]的方法并加以改良，在角质形成细胞无血清培养基（keratinocyte-SFM）（Invitrogen；Carlsbad，CA，USA）中，对EPI-Model进行了经皮24小时斑贴试验。Triton X-100处理的样本用Cy5标记，PaCDase或S1P处理的样本用Cy3标记。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
