核酸诱导角质形成细胞趋化因子表达数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.82570/szte_datarepo_detfw-gx013

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

数据集描述：本数据集包含一项研究中的基因表达数据，该研究探讨了核酸诱导炎症后人类角质形成细胞中趋化因子的调控。研究检查了合成RNA和DNA类似物如何影响趋化因子的表达模式，重点在于识别参与炎症反应的模式识别受体和信号通路。研究概述：正常人类表皮角质形成细胞（NHEKs，第三代）经合成核酸poly(dA:dT)和poly(I:C)处理，以模拟慢性皮肤疾病特征性的自身核酸炎症。研究表明，细胞质核酸主要通过NF-κB信号通路强烈诱导CCL2、CXCL10和CX3CL1的表达。数据处理：所有基因表达数据均采用定量PCR（qPCR）通过ΔΔCt方法生成。表达值以相对于未处理对照样本的倍数变化表示，并列出每种实验条件下的个体供体值。RNA提取、cDNA合成和qPCR方案遵循标准程序，并设有适当的质量控制。

数据集应用：该数据部分支持了Kelemen等人于2022年发表的研究成果，DOI: 10.3390/ijms23010540（qPCR阵列），并为研究人员提供了全面的表达谱，用于研究趋化因子调控、角质形成细胞中的先天免疫信号传导，以及与皮肤病（包括银屑病、特应性皮炎、白癜风和斑秃）相关的炎症通路。技术说明：数据以相对表达值的形式提供，已根据管家基因进行归一化（大多数实验使用GAPDH；qPCR阵列使用多个对照）。每个工作表代表独立的实验设计，详见方法学描述。数据文件中包含以下工作表：qPCR_array：在正常人角质形成细胞（NHEKs）上进行的定制qPCR阵列结果，如Kelemen等人于2022年所述（DOI: 1

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。