人类特应性皮炎与小鼠模型全局基因组谱分析的主要差异
该数据集来自 omicsdi.org，主题为转录组学，聚焦皮肤疾病中的特应性皮炎。研究通过基因组谱分析比较人类特应性皮炎与小鼠模型之间的转录组差异，涵盖五个模型及其各自对照，并纳入一个已发表的小鼠数据集 GSE50400
基本信息
资源简介
人类特应性皮炎与小鼠模型全局基因组谱分析的主要差异
该数据集英文名为“Major differences between human atopic dermatitis and murine models as determined by global genomic profiling”，来自 omicsdi.org，主题标签为转录组学（Transcriptomics），在站内归入皮肤疾病 / 其他类别。研究以基因组谱分析为手段，评估多种小鼠特应性皮炎模型之间的转录组差异，并将其置于与人类特应性皮炎相比较的框架下考察。数据集覆盖五个模型及其各自对照，同时纳入一个此前已发表的小鼠数据集 GSE50400。整体而言，该数据集面向皮肤疾病中特应性皮炎相关的转录组比较研究，适合关注疾病模型转录组特征、模型间差异以及跨物种比较的研究者参考使用。
【数据集背景】
特应性皮炎是一种常见的皮肤疾病，研究者常借助小鼠模型来模拟其病理过程并开展机制与干预研究。不同小鼠模型在遗传背景、诱发方式和表现特征上存在差异，这些差异是否以及如何在转录组层面体现，是理解模型适用性的关键问题。该研究正是基于这一背景，应用基因组谱分析对多个小鼠特应性皮炎模型进行转录组层面的比较，以刻画模型之间以及模型与对照之间的表达差异，并围绕人类特应性皮炎与小鼠模型之间的差异展开分析。
【数据内容】
数据集包含五个模型及其各自对照的表达数据，并纳入一个已发表的小鼠数据集 GSE50400。按源站描述，所纳入的模型分为四组：第 1 组病变侧为 Flaky tail 与 FLG 突变模型，对照为 C57BL/6NCrSlc；第 2 组病变侧为 NC/Nga（+螨），对照为 NC/Nga（-螨）；第 3 组病变侧为 OVA-ODT 24h，对照为 C57BL/6NCrSlc；第 4 组病变侧为 OXA 2h，对照为 BALB/c 与丙酮处理。上述分组信息构成了数据集在样本组织层面的核心内容，主题标签为转录组学。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，源站对其研究内容给出了上述描述。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及原始数据的具体提交机构等，源站未提供。
【适用场景】
基于其转录组学主题与特应性皮炎模型比较的设计，该数据集可用于考察不同小鼠特应性皮炎模型在转录组层面的异同，比较各模型与其对照之间的表达差异，并支持围绕人类特应性皮炎与小鼠模型差异的分析性研究。对于需要了解多种模型转录组特征的研究者，该数据集提供了可参考的比较基础。具体分析类型与适用范围以源站描述为准，源站未提供更细化的适用场景说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、预处理流程与分析工具等均未说明。使用者需依据来源站点的公开信息自行确认获取与分析方式。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，包括样本量、测序深度、数据完整性或质控指标等。需要说明的是，该数据集聚焦于小鼠模型的转录组比较，并纳入一个已发表的小鼠数据集 GSE50400；关于人类样本的具体构成与规模，源站未提供。使用时应结合源站描述谨慎界定结论的适用范围。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用前，应自行向来源站点核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE81119
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中，我们应用基因组图谱分析来评估特应性皮炎小鼠模型之间的转录组差异。我们评估了五个模型及其各自对照组，以及一个先前发表的小鼠数据集（GSE50400）的表达数据。纳入的模型包括第1组（病变组：Flaky tail和FLG突变体；对照组：C57BL/6NCrSlc）、第2组（病变组：NC/Nga(+螨)；对照组：NC/Nga(-螨)）、第3组（病变组：OVA-ODT 24小时；对照组：C57BL/6NCrSlc）和第4组（病变组：OXA 2小时；对照组：BALB/c，丙酮）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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