特发性炎症性肌病:肌肉活检判读的评分者间变异性

背景:尽管肌肉活检分类标准对诊断特发性炎症性肌病(IIM)亚组具有重要意义,但这些标准尚未标准化也未经验证。目的:我们试图确定诊断单个肌肉活检异常的评分者间变异性

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图像分类特发性炎症性肌病肌肉活检评分者间变异性皮肤疾病病理学免疫组化
Idiopathic inflammatory myopathy: inter-rater variability in muscle biopsy reading

基本信息

模态
图像
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

特发性炎症性肌病:肌肉活检判读的评分者间变异性

该数据集英文名为“Idiopathic inflammatory myopathy: inter-rater variability in muscle biopsy reading”,聚焦特发性炎症性肌病(IIM)诊断中肌肉活检判读的评分者间变异性问题。特发性炎症性肌病是一组以肌肉炎症为特征的疾病,其亚组诊断在很大程度上依赖肌肉活检的分类标准,然而这些标准此前既未标准化,也未经过验证。该数据集围绕一项旨在量化单个肌肉活检异常诊断中评分者间变异性的研究而建立,汇集了来自疑似IIM患者的肌肉活检样本切片,并借助在线平台供国际专家工作组的专家进行判读与评分,以考察专家之间在肌病理特征判断上的一致性。数据集以CC0 1.0通用公有领域贡献许可发布,可在公有领域范围内自由使用。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面作进一步说明。

【数据集背景】

特发性炎症性肌病(IIM)亚组的诊断中,肌肉活检分类标准具有重要地位,但这些标准尚未实现标准化,也未经过验证。正是在这一背景下,相关研究试图确定诊断单个肌肉活检异常时的评分者间变异性。研究团队开发了一套评分工具,用于分析一个国际专家临时工作组在肌肉活检判读中的共识情况。该数据集即产生于这一研究目的,其核心关注点并非某一特定诊断结论,而是不同判读者在面对同一肌肉活检切片时判断的一致程度,这对于理解现有分类标准在实际判读中的可靠性具有基础性意义。

【数据内容】

数据集涉及二十四份来自疑似IIM患者的样本,这些样本经随机选取,并提供采用标准组织学与免疫组织化学方法染色的切片。切片被置于在线平台上供专家判读。专家需就四个病理领域内的肌病理特征作出判断,这四个领域分别为肌肉纤维、炎症、结缔组织和血管系统。此外,案例还附有简短的临床表现信息,专家在此基础上给出初步诊断。源站描述在此处中断,关于切片图像的具体格式、文件数量、标注字段等更细粒度的数据组织信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于search.dataone.org。样本取自疑似IIM患者,经随机选择产生二十四份样本,切片采用标准组织学与免疫组织化学方法染色,并通过在线平台向国际专家工作组的专家开放判读。专家围绕四个病理领域的肌病理特征接受询问,并结合简短的临床表现给出初步诊断。关于样本采集的具体机构、时间范围、患者人群构成以及专家组成员的具体人数与背景,源站未提供。

【适用场景】

基于其研究设计,该数据集适用于考察肌肉活检判读中的评分者间一致性问题,可用于分析不同判读者在肌肉纤维、炎症、结缔组织和血管系统等病理领域内识别肌病理特征时的差异。它也可用于讨论IIM亚组诊断中分类标准标准化与验证的需求,以及评分工具在共识分析中的作用。由于数据涉及疑似IIM患者的肌肉活检切片与专家判读,其潜在用途集中在方法学与判读一致性研究层面。关于该数据集在其他具体研究或教学场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

按照源站描述,切片通过在线平台提供,专家在平台上查看采用标准组织学与免疫组织化学方法染色的切片,并针对四个病理领域内的肌病理特征进行判读,同时结合简短的临床表现给出初步诊断。评分工具用于分析专家判读中的共识情况。关于数据的具体访问方式、文件组织格式、是否附带判读结果或评分记录,以及复现分析所需的操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的一个明确限制体现在其样本规模上:共二十四份来自疑似IIM患者的样本,且为随机选取。研究本身即指向肌肉活检分类标准尚未标准化、未经验证这一问题,评分者间变异性的存在正是其考察对象。源站描述在说明专家被要求给出初步诊断处中断,因此关于判读结果的完整内容、共识分析的具体结论以及数据的完整性程度,源站未提供。此外,关于切片染色的质量控制细节、判读过程中的一致性保障措施等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集以CC0 1.0 Universal(CC0 1.0)公有领域贡献许可发布。使用时应遵循该许可条款。关于推荐的引用格式、原始研究论文的完整题录信息以及数据发布者的具体署名要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A5c3a68d045c44b5d4f8b3f3afffb6d948d4d749ab3aac834f3574a215f34123a

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景:尽管肌肉活检分类标准对诊断特发性炎性肌病(IIM)亚组具有重要意义,但这些标准尚未实现标准化,也未经有效性验证。目的:我们旨在确定不同评估者在诊断各具体肌肉活检异常时的评估者间变异度。方法:我们开发了一种评分工具,用于分析一个由国际专家组成的特设工作组在肌肉活检判读中的共识情况。随机选取了24份疑似IIM患者的样本,提供采用标准组织学和免疫组织化学方法染色的切片。切片被上传至在线平台,专家们被询问四个病理领域内的肌肉病理学特征:肌纤维、炎症、结缔组织和血管系统。研究还附有病例的简短临床表现,并要求专家对多发性肌炎、皮肌炎、包涵体肌炎、抗合成酶综合征相关肌炎、免疫介导性坏死性肌病、非特异性肌炎或其他疾病给出初步诊断。

Fleiss Kappa值用于评估评分者间变异性,显示在肌纤维和结缔组织领域的评分者一致性最高。结果:尽管总体Kappa值较低,但初步诊断达到了中等程度的一致性,支持整体性肌肉活检解读的理念,而非将各个特征简单相加。结论:我们认为,对单个病理特征的评估需要标准化和统一化,并应针对亚组分类测量其敏感性和特异性。标准化诊断性肌肉活检阅片流程将有助于为即将开展的治疗试验识别出更同质的患者队列。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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