GSE86315：Imiquimod在小鼠中具有品系依赖性效应且不能唯一模拟人类银屑病

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE86315

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

背景：咪喹莫特（IMQ）在小鼠中可诱发一种皮肤表型，该表型常被用作人类银屑病的急性模型进行研究。然而，这种表型是否依赖于品系或性别，此前从未在大规模范围内进行过系统性研究。此类效应可能导致研究之间的冲突，同时进一步影响研究结果及研究成果的转化。方法：采用RNA-seq评估IMQ在7个小鼠品系（C57BL/6J、BALB/cJ、CD1、DBA/1J、FVB/NJ、129X1/SvJ和MOLF/EiJ）的两种性别中所诱发的银屑病样表型。结果：在大多数品系中，IMQ对基因表达的改变与人类银屑病一致，部分归因于先天免疫激活和稳态基因表达下降。然而，MOLF雄性小鼠的IMQ反应异常，分化相关基因表达下降（在其他品系中升高）。两个最常研究的品系（BALB/c和C57BL/6）之间，IMQ反应的关键方面存在差异。

与BALB/c相比，C57BL/6表型显示与DNA复制、IL-17A激活和CD8+ T细胞相关的基因表达增加，但与干扰素信号传导和CD4+ T细胞相关的基因表达减少。令人惊讶的是，尽管IMQ诱导的表达变化与银屑病相似，但其与其他人类皮肤疾病（如焦痂、痤疮、特应性皮炎）的对应关系相似或更好。对于BALB/c、MOLF和129X1品系，IMQ改变的基因与人类皮肤感染或伤口中改变的基因对应关系优于与银屑病皮损中改变的基因的对应关系。结论：这些发现证明了IMQ皮炎的品系依赖性方面，在规划和解释实验研究时应予以考虑。我们进一步表明，IMQ并非独特地模拟银屑病，而是实际上触发了一组活跃于多种皮肤疾病的核心通路。这些观察结果挑战了将IMQ皮炎视为独特适用于s的小鼠表型的观点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。