Der f/SEB诱导的皮肤炎症数据集
源站描述指出,该研究利用屋尘螨提取物与葡萄球菌肠毒素 B 反复表皮涂抹建立特应性皮炎样小鼠模型,并比较其与人类 AD 皮肤的全局基因表达模式

基本信息
资源简介
Der f/SEB诱导的皮肤炎症数据集
Der f/SEB-induced skin inflammation
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Der f/SEB 诱导的皮肤炎症,包含 1 个表达谱芯片文件 GSE53132_series_matrix.txt.gz,平台为 GPL10787,物种为小鼠(10090)。源站描述指出,该研究利用屋尘螨提取物与葡萄球菌肠毒素 B 反复表皮涂抹建立特应性皮炎样小鼠模型,并比较其与人类 AD 皮肤的全局基因表达模式。数据可用于分析表皮生长分化、皮肤屏障、脂质能量代谢、免疫应答及细胞外基质相关基因表达,并支持肥大细胞与 T 细胞在皮炎发生中作用的研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 09 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):特应性皮炎(AD)是一种慢性瘙痒性炎症性皮肤病。我们最近描述了一种动物模型,其中反复表皮涂抹屋尘螨提取物和葡萄球菌肠毒素 B 诱导出湿疹样皮肤病变。在本研究中,我们表明人类 AD 皮肤与过敏原/葡萄球菌肠毒素 B 诱导的小鼠皮肤病变之间的全局基因表达模式非常相似,特别是在与表皮生长/分化、皮肤屏障、脂质/能量代谢、免疫应答或细胞外基质相关的基因表达方面。在该模型中,肥大细胞和 T 细胞(而非 B 细胞或嗜酸性粒细胞)被证明是皮炎完全表达所必需的,如缺乏肥大细胞或 T 细胞的小鼠(TCRb-/- 或 Rag1-/-)中皮肤炎症减轻和血清 IgE 水平降低所揭示。皮炎的临床严重程度与
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10787、10090。本站分类:皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53132
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 02 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
特应性皮炎(AD)是一种慢性瘙痒性炎症性皮肤病。我们近期描述了一种动物模型,其中反复经表皮应用屋尘螨提取物和葡萄球菌肠毒素B可诱导湿疹样皮肤病变。在本研究中,我们发现全局基因表达模式在人AD皮肤与过敏原/葡萄球菌肠毒素B诱导的小鼠皮肤病变之间非常相似,尤其是在与表皮生长/分化、皮肤屏障、脂质/能量代谢、免疫反应或细胞外基质相关的基因表达方面。在该模型中,肥大细胞和T细胞(而非B细胞或嗜酸性粒细胞)被证明是皮炎完全表达所必需的,这一点通过缺乏肥大细胞或T细胞的小鼠(TCRb-/-或Rag1-/-)中皮肤炎症减轻和血清IgE水平降低得以揭示。皮炎的临床严重程度与肥大细胞数量相关,而与嗜酸性粒细胞数量无关。
与2型辅助性T细胞(Th2)在过敏性疾病中发挥主导作用的观点一致,达到最大临床评分需要Th2促进性细胞因子胸腺基质淋巴细胞生成素的受体以及高亲和力IgE受体FceRI。因此,这一临床相关模型为人类特应性皮炎(AD)的致病机制提供了机制性见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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