GSE330551:Th2预激固有免疫放大定义特应性皮炎独特内型
研究整合 30 项研究、超过 1,300 份皮损与非皮损皮肤转录组,识别出两种稳定的 AD 内型,共享屏障破坏与 2 型活化的皮损核心程序;内型 2 以 108 基因固有免疫炎症特征、髓系浸润增加及金黄色葡萄球菌相关菌群失调为特点

基本信息
资源简介
GSE330551:Th2预激固有免疫放大定义特应性皮炎独特内型
Th2-primed innate immune amplification defines a distinct atopic dermatitis endotype
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Th2-primed innate immune amplification defines a distinct atopic dermatitis endotype,聚焦特应性皮炎(AD)的分子内型。研究整合 30 项研究、超过 1,300 份皮损与非皮损皮肤转录组,识别出两种稳定的 AD 内型,共享屏障破坏与 2 型活化的皮损核心程序;内型 2 以 108 基因固有免疫炎症特征、髓系浸润增加及金黄色葡萄球菌相关菌群失调为特点。数据可用于 AD 内型分类、治疗反应预测及分子机制探索(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):特应性皮炎(AD)在临床上具有异质性,但可重复的分子内型仍未完全明确。通过整合来自 30 项研究的超过 1,300 份皮损与非皮损皮肤转录组,我们识别出两种稳健的 AD 内型,它们共享一个保守的皮损核心程序,即屏障破坏和 2 型活化。与内型 1(62%)相比,内型 2(38%)以紧凑的 108 基因固有免疫炎症特征(包括 IL1B 和 IL6)、髓系浸润增加以及与金黄色葡萄球菌相关的菌群失调为特征。内型归属在纵向数据集中保持稳定,全身治疗时仅出现有限、非系统性的转换。对试验和观察数据的分析提供了初步证据,表明与内型 1 相比,内型 2 在 dupilumab 治疗下临床反应较低且残留分子活性较高。交互建模
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL18573、9606。本站分类:皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330551
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 13 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
特应性皮炎(AD)在临床上具有异质性,但可重复的分子内型仍未完全明确。通过整合来自30项研究的超过1,300份皮损与非皮损皮肤转录组,我们识别出两种稳健的AD内型,它们共享一个保守的皮损核心程序,即屏障破坏和2型活化。与内型1(62%)相比,内型2(38%)以紧凑的108基因固有免疫炎症特征(包括IL1B和IL6)、髓系浸润增加以及与金黄色葡萄球菌相关的菌群失调为特征。内型分型在纵向数据集中保持稳定,全身治疗下仅出现有限且非系统性的转换。对试验和观察数据的分析提供了初步证据,表明与内型1相比,内型2在度普利尤单抗治疗下临床应答较低且残余分子活性较高。对Th2和固有免疫模块活性的交互建模揭示了一种Th2放大的固有免疫状态,可预测内型2,这与功能实验相平行,在功能实验中IL-1b/IL-6与Th2细胞因子协同作用,加剧角质形成细胞炎症并损害角质形成细胞分化。
我们的发现为阿尔茨海默病的生物学多样性提供了新见解,并为机制分层奠定了坚实基础,对治疗策略具有重要意义。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




