银屑病样炎症小鼠模型脾组织转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329912

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在表征由不同实验方法诱导的银屑病样小鼠模型脾脏中的转录组变化。银屑病是一种慢性炎症性疾病，与皮肤以外的全身免疫失调相关。在本研究中，使用雌性BALB/c小鼠，通过背部皮肤（PSO-D）或耳部（PSO-E）局部涂抹咪喹莫特（IMQ），以及IL-23诱导的耳部炎症，建立银屑病样炎症模型。对照小鼠（Con）接受溶媒处理。收集脾脏组织进行RNA测序（RNA-seq），以研究全身免疫反应。从脾脏组织中提取总RNA并进行高通量测序。将干净读段比对到小鼠参考基因组（GRCm39），并定量基因表达水平。进行了差异表达分析和功能富集分析（包括基因本体论和KEGG通路）。该数据集为理解不同银屑病样模型中的全身免疫改变提供了全面资源，并可能有助于阐明免疫失调的潜在机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。