GSE328048：单细胞转录组揭示特应性皮炎中参与分化改变和炎症反应的角质形成细胞亚群

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE328048

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数据说明

特应性皮炎（AD）是一种常见的慢性炎症性皮肤病，其发病机制复杂且因机制异质性而认识不足。为探究其潜在机制，我们对42例AD患者的皮损（LAD）和非皮损（NAD）皮肤以及23例健康对照（HC）的皮肤进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）。角质形成细胞（KC）是鉴定出的最丰富的细胞类型。在健康皮肤中，KC分化遵循从基底KC（BK）经七个分化阶段（DK1–DK7）至终末角化细胞（KK1和KK2）的线性轨迹。在LAD中，该过程被破坏，表现为从KK2向KK1的反向转变，主要由DK7驱动。APOD和LYZ被鉴定为LAD中这种异常角化的特异性调控因子，与IL-13和IL-22驱动的涉及内质网（ER）应激和氧化损伤的反应相关。线粒体和ER功能障碍在LAD的DK6细胞中特异性富集，提示该亚群是与细胞因子激活相关的关键致病区室。

此外，细胞间相互作用分析（通过Xenium空间转录组学和免疫组织化学验证）突显了来源于IL13+ Th2细胞和增殖性T细胞的TWEAK作用于FN14+基底细胞和分化型KC，是AD相关表皮反应的关键促进因素。这些发现揭示了KC分化受损和特定免疫通路如何促进AD发病机制，并将不同的细胞区室和炎症回路确定为潜在的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。