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创建/更新时间

2026-10-19

资源简介

血液IL-6是人特应性皮炎小鼠模型抑郁症状的关键触发因素

GSE318233 数据集来自 NCBI GEO，围绕“血液 IL-6 是人特应性皮炎小鼠模型中抑郁症状的关键触发因素”这一研究主题构建。该数据集通过单细胞 RNA 测序，分析人特应性皮炎小鼠模型海马组织中的基因表达特征，目的是识别对 IL-6 响应的海马细胞类型。数据来源于在 SPF 条件下维持的无皮炎小鼠，对其海马组织进行表达谱分析，以刻画与 IL-6 相关的细胞特征。数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE318233_series_matrix.txt.gz，属于皮肤疾病/其他分类，主题标签涉及高通量测序表达谱分析，作者为 Hiroshi Matsuda，发布时间为 Jan 30 202。

【数据集背景】

该数据集对应一项关于特应性皮炎与抑郁症状关联机制的研究。研究关注血液中的 IL-6 作为关键触发因素，在模拟人类特应性皮炎的小鼠模型中引发抑郁症状的可能性。为在细胞层面理解这一过程，研究采用单细胞 RNA 测序技术，对海马组织进行分析。海马是与情绪调节相关的重要脑区，因此在该组织上识别对 IL-6 响应的细胞类型，有助于从转录组层面刻画皮炎相关系统性因素影响中枢神经系统的细胞基础。数据集标题与源站标题一致，均强调血液 IL-6 在特应性皮炎小鼠模型抑郁症状中的触发作用。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE318233_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。该文件属于表达谱数据矩阵类文件，通常用于承载样本层面的基因表达信息。源站描述指出，研究对海马组织进行了单细胞 RNA 测序，所用海马来自在 SPF 条件下维持的无皮炎小鼠，分析内容为基因表达谱，以表征与 IL-6 相关的细胞特征。主题标签中包含 GPL24247 与 10090，分别对应平台与物种相关的标识信息。数据集分类为皮肤疾病/其他，主题方向为高通量测序表达谱分析。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 数据库收录的数据集。源站描述说明，海马组织取自无皮炎、在 SPF 条件下维持的小鼠，随后进行单细胞 RNA 测序，以识别对 IL-6 响应的海马细胞类型。作者为 Hiroshi Matsuda，发布时间为 Jan 30 202。数据集英文名称为“GSE318233: Blood IL-6 is a critical trigger of depressive symptoms in a mouse model for human atopic dermatitis”，源站标题与之一致。

【适用场景】

该数据集适用于围绕特应性皮炎与中枢神经系统相互作用的研究场景，尤其是关注 IL-6 作为血液来源触发因素如何影响海马细胞类型的研究。由于数据为海马组织的单细胞 RNA 测序表达谱，可用于探索海马内不同细胞类型对 IL-6 的响应特征，也可用于与皮炎模型相关的神经免疫或神经炎症研究背景下的表达模式分析。数据集分类为皮肤疾病/其他，亦可作为皮肤疾病系统性影响研究的参考数据。具体分析方向应结合源站描述所界定的研究目的，不宜超出数据本身覆盖的范围。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE318233_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因文件编码或字段解析问题导致后续分析偏差。由于数据集仅包含 1 个文件，使用时应以该文件为主要数据载体，结合源站描述理解其对应的海马单细胞 RNA 测序表达谱内容。对于平台与物种标识信息，可参考主题标签中给出的 GPL24247 与 10090。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、批次效应、样本数量、测序深度或细胞数量等方面的具体说明。数据集仅含 1 个文件，文件样例为 GSE318233_series_matrix.txt.gz，未提供其他辅助文件信息。源站描述仅说明海马组织来自 SPF 条件下维持的无皮炎小鼠，未提供更详细的动物个体信息、实验分组或质控指标。使用者在解释结果时，应限于源站描述所界定的研究范围，不宜外推至其他物种、其他组织或其他疾病模型。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。作者信息为 Hiroshi Matsuda，发布时间为 Jan 30 202。使用该数据集时，应遵循来源站 ncbi.nlm.nih.gov 的相关规定，具体引用与许可要求以源站说明为准。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318233

访问原始数据

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数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318233

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用特应性皮炎小鼠模型的海马组织进行单细胞RNA测序，以鉴定对IL-6有反应的海马细胞类型。从维持在SPF条件下、无皮炎的小鼠中获取海马，并分析基因表达谱以表征IL-6相关的细胞特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别