GSE307681:真皮成纤维细胞响应白细胞介素-4和13并促进特应性皮炎中的T细胞募集
研究聚焦特应性皮炎中真皮成纤维细胞对IL-4和IL-13的响应及其促进T细胞募集的作用,涉及人AD皮肤与小鼠模型的单细胞RNA测序、IL-4Rα依赖的趋化因子高表达成纤维细胞亚群,以及体外IL-4/IL-13与炎症细胞因子协同诱导CCR3配体(如Ccl8)表达和CCR3依赖的T细胞迁移

基本信息
资源简介
GSE307681:真皮成纤维细胞响应白细胞介素-4和13并促进特应性皮炎中的T细胞募集
Dermal fibroblasts respond to interleukin-4 and 13 and promote T-cell recruitment in atopic dermatitis
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE307681_series_matrix.txt.gz),主题为表达谱高通量测序,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。研究聚焦特应性皮炎中真皮成纤维细胞对IL-4和IL-13的响应及其促进T细胞募集的作用,涉及人AD皮肤与小鼠模型的单细胞RNA测序、IL-4Rα依赖的趋化因子高表达成纤维细胞亚群,以及体外IL-4/IL-13与炎症细胞因子协同诱导CCR3配体(如Ccl8)表达和CCR3依赖的T细胞迁移。数据可用于探究成纤维细胞在AD炎症中的转录异质性与趋化功能(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):特应性皮炎(AD)是一种以2型免疫反应为特征的慢性炎症性皮肤病。虽然免疫细胞和角质形成细胞已被确认为AD发病机制的贡献者,但真皮成纤维细胞的作用仍较少被定义。在此,我们研究了成纤维细胞是否通过响应2型细胞因子产生趋化因子来促进T细胞募集。对人AD皮肤和小鼠模型(包括IL-4受体缺陷小鼠)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示了转录上不同的成纤维细胞簇,其中IL-4Rα依赖的群体表达高水平趋化因子。在体外,IL-4/IL-13与炎症细胞因子(Inf;TNFa + IL-17A + IL-1b)协同诱导成纤维细胞表达CCR3配体,包括Ccl8。来自受刺激成纤维细胞的条件培养基以CCR3依赖的方式促进T细胞迁移。此外,药理学i
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307681
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 10 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
特应性皮炎(AD)是一种以2型免疫应答为特征的慢性炎症性皮肤病。尽管免疫细胞和角质形成细胞已被确认为AD发病机制的重要参与者,但真皮成纤维细胞的作用仍不明确。本研究探讨了成纤维细胞是否通过响应2型细胞因子产生趋化因子来参与T细胞募集。对人AD皮肤及小鼠模型(包括IL-4受体缺陷小鼠)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示了转录上不同的成纤维细胞簇,其中IL-4Rα依赖性群体高表达趋化因子。体外实验中,IL-4/IL-13与炎性细胞因子(Inf;TNFa + IL-17A + IL-1b)协同诱导成纤维细胞表达CCR3配体,包括Ccl8。受刺激成纤维细胞的条件培养基以CCR3依赖性方式促进T细胞迁移。此外,药理学抑制CCR3可减少两种AD小鼠模型中的T细胞浸润和皮肤炎症。
这些发现表明,真皮成纤维细胞并非被动的结构细胞,而是2型炎症的积极参与者,通过产生趋化因子促进T细胞募集,从而参与特应性皮炎(AD)的发病机制。靶向成纤维细胞–CCR3轴可能代表一种新的AD治疗策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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