GSE306437：独特B细胞与浆细胞特征区分化脓性汗腺炎、银屑病与特应性皮炎

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306437

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景 化脓性汗腺炎（HS）、银屑病（PsO）和特应性皮炎（AD）是炎症性皮肤病，尽管它们共享一些免疫通路，但具有独特的发病机制和不同的病理特征。例如，Th17细胞是PsO发病机制的核心，也与HS炎症有关。另一方面，AD通常被称为Th2介导的疾病，然而与健康个体相比，HS患者患AD的可能性是前者的两倍，表明HS与AD之间存在关联。目的 迄今为止，尚未直接比较HS、PsO和AD的转录组学。因此，本研究旨在评估HS、PsO和AD皮损之间的转录组学差异，以确定定义HS炎症的生物学特征。方法 对19例健康对照、15例HS、21例PsO和15例AD皮损皮肤样本进行了批量RNA测序。结果 主成分分析（PCA）发现，与健康对照皮肤相比，HS皮损具有独特的转录组，炎症介质表达增加，炎症通路更为活跃，包括TNF、IL-17和B细胞信号通路。

PsO皮损以强烈的IL-17特征为定义，虽然HS皮损中也存在IL-17特征，但HS通过独特的B细胞特征与PsO皮损相区分。与AD皮损相比，HS皮损具有更复杂的炎症特征，涉及TNF、B细胞和NLR信号传导，而AD皮损中Th2相关基因高表达。加权基因共表达分析提示T细胞信号传导和表皮发育是PsO皮损的重要特征，而HS皮损可通过补体激活、B细胞信号传导和成纤维细胞相关通路来定义，提示HS中存在瘢痕形成的潜在可能。细胞类型去卷积分析发现PsO中角质形成细胞和T细胞富集，AD中Th2细胞富集，HS中B细胞和浆细胞富集。最后，基因表达

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。