GSE302133：Malassezia与亚洲绝经期皮肤

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302133

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

绝经伴随皮肤变化，包括瘙痒、发红和皮肤干燥等主诉，与表皮变薄和皮脂腺活动减少有关。这些变化可导致微生物组失调，进而引发皮肤病。马拉色菌是一种普遍存在、依赖脂质且占优势的皮肤真菌，与多种皮肤疾病和系统性疾病相关。然而，在绝经等宿主生理变化背景下，其致病机制尚未被探索。我们研究了345名涵盖绝经前、围绝经期和绝经后的亚洲女性的皮肤宏基因组，揭示了马拉色菌菌种在流行率和丰度上存在绝经阶段特异性差异。在角质形成细胞共培养中，马拉色菌超过临界真菌阈值后引发细胞毒性，侵入角质形成细胞并诱导炎症。暴露于毒性真菌载量的角质形成细胞的转录组分析揭示了多种炎症性皮肤病中存在的过度增殖和未分化表型所特有的基因表达谱。我们的发现揭示了绝经驱动的皮肤生理变化与马拉色菌介导的角质形成细胞功能障碍之间的机制联系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。