特应性皮炎合并复发性疱疹性湿疹具有多种并存的表皮炎症内型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262071

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

一部分特应性皮炎（AD）患者会反复发生播散性单纯疱疹病毒（HSV）皮肤感染，即疱疹性湿疹（EH）。为明确ADEH疾病发生背后皮肤与免疫系统病理生物学的转录机制，我们对有EH病史（ADEH+，n=15）和无EH病史（ADEH-，n=13）的AD患者以及健康对照（HC，n=15）的非皮损皮肤（表皮、真皮）进行了RNA测序分析。我们还对参与者体外经HSV-1感染的浆细胞样树突状细胞（pDC）进行了RNA测序。ADEH+患者表现出基因表达失调，其范围在真皮中有限（差异表达基因[DEGs]=14），而在表皮中更为广泛（DEGs=129）。ADEH+上调的表皮DEGs富集于2型细胞因子（T2）（IL4R、CCL22、CRLF2、IL7R）、干扰素（CXCL10、ICAM1、IFI44、IRF7）和IL-36γ（IL36G）炎症基因通路。所有ADEH+参与者均表现出T2和干扰素内型，且87%为IL36G高表达。相比之下，这些内型在ADEH-参与者中的表达变异更大。

ADEH+皮肤还失调了表皮分化复合体（EDC）基因在LCE、S100和SPRR家族中的表达，这些基因涉及皮肤屏障功能和抗菌活性。pDC对HSV-1感染的转录反应未受ADEH状态影响。ADEH+风险背后的病理生物学与一种独特的、多方面的表皮炎症相关，这种炎症伴随EDC基因的失调。这些发现将有助于指导未来研究，以明确这些炎症模式如何驱动AD中疱疹性湿疹的风险。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。