GSE248604：通过调节间接微生物组相互作用减轻口罩痘

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248604

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数据说明

在COVID-19大流行期间，口罩在防止病毒颗粒通过人际飞沫传播方面发挥了关键作用。然而，长时间佩戴口罩会引起皮肤刺激，俗称“口罩痘”（mask + acne），表现为痤疮和接触性皮炎，主要由致病性皮肤微生物引起。先前的研究表明，推测的致病微生物为厌氧菌，但口罩相关皮肤病的发病机制仍不明确。因此，我们采用依赖培养和不依赖培养的方法，表征了口罩相关皮肤微生物群在口罩痘发生中的作用。宏基因组分析显示，口罩微生物群中的大多数为厌氧菌，来源于皮肤而非唾液。先前的工作已证明微生物组中致病菌与拮抗菌株之间存在直接相互作用。我们将这一分析扩展至包括致病菌与其他本土细菌之间的间接相互作用，这些本土细菌被分类为“致病菌辅助（PH）”或“致病菌抑制（PIn）”菌株。

从口罩中分离的细菌经体外筛选，鉴定出既能拮抗病原菌生长又能促进病原菌生长的菌株。这些数据通过小鼠皮肤感染模型得到验证，在该模型中我们观察到病原菌感染后症状的减轻。此外，病原菌辅助菌抑制株（IPH株）在体外和体内均不能直接减弱病原菌生长，但通过PH抑制性抗菌产物（如苯乳酸）间接抑制症状发展和病原菌生长。综上所述，本研究首次定义了一种机制，即口罩下微生物群的间接相互作用通过抑制皮肤病原菌来控制口罩痘症状。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。