GSE245577：人接触性过敏中不同皮肤驻留细胞群体的相关性

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE245577

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数据说明

金属过敏是迟发型超敏反应的典型例子，分为两个阶段：致敏和激发。致敏发生在初次接触过敏原时，导致皮肤驻留细胞活化并形成金属反应性T细胞。在激发阶段，这些T细胞发起免疫反应，在接触后约72小时引起瘙痒性湿疹等症状。研究已确定接触性超敏反应启动涉及两种主要机制：相应过敏原对先天免疫受体（如Toll样受体4）的直接激活，以及通过NLRP3炎症小体的条件性先天免疫激活。激发阶段以细胞毒性T细胞的活性为主导，但尚不清楚是否仅由金属反应性循环T细胞参与，还是组织驻留T细胞也有贡献。为确定介导人类镍超敏反应的相关细胞类型和信号，我们对一名对镍（而非铬）致敏的供者细胞进行了单细胞RNA测序，该供者经表皮分别暴露于稀释剂或两种金属8小时或72小时。

我们的结果表明，镍暴露在8小时内特异性激活了特定亚群的内皮细胞、基底上层角质形成细胞和CCR7+树突状细胞，而铬暴露未观察到这一反应。皮肤驻留T细胞未参与早期超敏反应，因为其在镍暴露8小时后的基因表达保持不变。然而，镍暴露72小时后，皮肤T细胞区室发生了显著变化，包括SELL+中枢记忆T细胞、效应Tc细胞、TH细胞和Treg细胞的浸润。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。