I型干扰素主导皮肤扁平苔藓炎症景观驱动界面皮炎反应[NTERT]
该数据集来自NCBI GEO,包含皮肤扁平苔藓(LP)与健康对照皮肤的单细胞RNA测序表达谱数据,文件为GSE240461_series_matrix.txt.gz
![GSE240461: Type I interferons dominate cutaneous lichen planus inflammatory landscape driving the interface dermatitis reaction [NTERT]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/160406.jpg)
基本信息
资源简介
I型干扰素主导皮肤扁平苔藓炎症景观驱动界面皮炎反应[NTERT]
Type I interferons dominate cutaneous lichen planus inflammatory landscape driving the interface dermatitis reaction [NTERT]
该数据集来自NCBI GEO,包含皮肤扁平苔藓(LP)与健康对照皮肤的单细胞RNA测序表达谱数据,文件为GSE240461_series_matrix.txt.gz。研究聚焦LP炎症机制,揭示皮损中I型干扰素富集环境涉及主要皮肤细胞组分,并识别出受IFN-I影响的炎症性角质形成细胞和成纤维细胞亚群以及独特的CD8+CXCL13+ T细胞群体。数据可用于探索LP的免疫病理特征、细胞亚群分类及干扰素相关标志物分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):皮肤扁平苔藓(LP)是一种慢性炎症性皮肤病,组织学特征为界面皮炎伴淋巴细胞浸润和角质形成细胞死亡。既往研究表明LP炎症以涉及IFN-g的I型免疫反应为主,但其发病机制尚未完全阐明。为探究LP的炎症机制,我们对LP与健康对照皮肤进行了单细胞RNA测序。我们证明LP患者皮损被富含I型干扰素(IFN-I)的环境所印记,涉及所有主要皮肤细胞组分。虽然所有免疫细胞都充满这种干扰素特征,但我们突出了在表皮-真皮交界附近受IFN-I高度影响的独特炎症性角质形成细胞和成纤维细胞亚群。我们还展示了一个独特的CD8+CXCL13+ T细胞群体 ex
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL17586、9606。本站分类:皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240461
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 02 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
皮肤扁平苔藓(LP)是一种慢性炎症性皮肤病,其组织学特征为界面皮炎,伴淋巴细胞浸润和角质形成细胞死亡。既往研究提示,LP炎症以涉及IFN-γ的I型免疫应答为主,但其发病机制尚未完全阐明。为探究LP的炎症机制,我们对LP与健康对照皮肤进行了单细胞RNA测序。我们证明,LP患者皮损皮肤呈现出富含I型干扰素(IFN-I)的环境特征,且涉及所有主要皮肤细胞组分。虽然所有免疫细胞均带有该干扰素特征,但我们重点揭示了在表皮-真皮交界附近受IFN-I高度影响的独特炎症性角质形成细胞和成纤维细胞亚群。我们还发现LP皮肤中存在独特的CD8+CXCL13+ T细胞群体,其表现出细胞毒性和表皮归巢标志物,同时伴有炎症性CD16+髓系细胞的富集。
在此,我们阐明IFN-I对 all 主要皮肤细胞类型尤其是角质形成细胞的作用可驱动界面皮炎反应,从而协调扁平苔藓皮肤中免疫细胞与基质细胞之间的交互对话。最后,我们提出靶向共同IFN-I受体IFNAR1可有效关闭扁平苔藓皮肤离体模型及一例狼疮性扁平苔藓皮肤病变患者中炎症通路的激活。总之,我们的数据全面刻画了扁平苔藓的免疫发病机制,并证明IFN-I在其炎症格局中的深度参与,为靶向IFN-I通路的药物用于扁平苔藓患者的治疗提供了依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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