银屑病与特应性皮炎重叠表型的基因组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE182740

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

银屑病与特应性皮炎之间的临床重叠有时难以辨别，对于应将重叠表型作为银屑病还是特应性皮炎进行治疗尚无共识。我们纳入了诊断为银屑病或特应性皮炎的患者，并在临床上将其重新分层为经典型银屑病、经典型特应性皮炎以及银屑病与特应性皮炎之间的重叠表型。我们比较了三个比较组之间皮损及非皮损皮肤活检组织的基因表达谱。重叠表型皮肤中的整体mRNA表达及T细胞亚群细胞因子表达与银屑病的表达谱一致，而与特应性皮炎的 expression 谱不同。无监督k-means聚类分析表明，三个比较组总人群的最佳不同聚类数为两个，且银屑病与特应性皮炎的两个聚类可通过基因表达加以区分。

我们的研究表明，银屑病与特应性皮炎之间的临床重叠表型具有银屑病的主要分子特征，并且基因组生物标志物能够在分子水平上区分具有银屑病和特应性皮炎谱系的患者中的银屑病与特应性皮炎。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。