特应性皮炎受累或未受累皮肤活检基因表达数据
该数据集为特应性皮炎（AD）受累或未受累皮肤活检的基因表达数据，来源于NCBI，包含1个文件（GSE174582_series_matrix.txt.gz），采用GPL96平台对9606物种进行表达谱分析
基本信息
资源简介
特应性皮炎受累或未受累皮肤活检基因表达数据
GSE174582 是一个聚焦特应性皮炎（Atopic Dermatitis，AD）皮肤组织基因表达的研究型数据集，其英文全称为 Gene expression data from skin biopsy of involved or uninvolved in Atopic Dermatitis (AD)。该数据集由 Hisashi Sugiura 提交，于 2021 年 5 月 17 日发布，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站将其归入皮肤疾病 / 其他分类。数据集的核心目的是分析 AD 受累皮肤、AD 未受累皮肤与正常皮肤之间基因表达的差异与相似性，采用表达谱芯片技术，平台为 GPL96，物种为 9606（人类）。数据集共包含 1 个文件，样例文件名为 GSE174582_series_matrix.txt.gz，适合用于皮肤疾病转录组层面的比较研究。
【数据集背景】
特应性皮炎是一种常见的慢性炎症性皮肤病，其皮损区与非皮损区在分子水平上可能存在显著差异，同时非皮损区是否已存在潜在异常也是研究关注的问题。该数据集正是围绕这一背景设计，通过比较 AD 受累皮肤、AD 未受累皮肤与正常皮肤的基因表达谱，揭示三者之间的差异与相似之处，为理解 AD 的发病机制、皮损形成过程以及潜在生物标志物提供数据基础。源站描述明确指出其分析目标为“Analysis of differences and similarities of gene expression among AD-involved, AD-uninvolved and normal skins”。
【数据内容】
数据集提供的是皮肤活检样本的基因表达数据，覆盖 AD 受累、AD 未受累以及正常皮肤三类样本的转录组表达信息。数据以表达谱芯片形式产生，平台标识为 GPL96，物种为人类（9606）。数据集仅包含 1 个文件，即 GSE174582_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件，通常整合了样本层面的表达值及相关注释信息。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL96 和 9606，反映了其技术路线与物种范围。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），由 Hisashi Sugiura 提交，发布时间为 2021 年 5 月 17 日。样本类型为皮肤活检组织，涉及 AD 受累部位、AD 未受累部位以及正常皮肤。源站标题与英文名一致，均强调“皮肤活检”与“受累或未受累”的样本设计。关于样本量、采集部位的具体解剖位置、受试者人口学信息及伦理审批细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于皮肤疾病特别是特应性皮炎相关的基因表达比较研究，可用于分析受累皮肤与未受累皮肤、正常皮肤之间的差异表达基因，探索疾病相关通路与分子机制；也可作为方法学研究的测试数据，用于芯片表达谱的预处理、归一化与差异分析流程验证。此外，对于关注 AD 皮损区与非皮损区分子特征的研究者，该数据集提供了可比较的表达谱资源。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE174582_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段结构、样本分组与编码方式，确认无误后再批量接入分析流程。由于文件为系列矩阵格式，通常需要解析样本列与基因行，并结合平台注释信息进行基因标识映射。具体分析步骤应依据研究目的设计，源站未提供额外的使用说明或分析脚本。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，样本量与分组平衡情况源站未提供，无法据此评估统计效力。数据为芯片表达谱，其质量受平台、杂交与扫描等实验环节影响，相关质控信息源站未提供。此外，数据集未提供临床元数据、伦理许可细节及原始图像文件，可能限制深入的协变量分析与结果复现。使用时应注意平台注释版本与基因标识转换带来的不确定性。
【引用与许可】
数据来源为 NCBI，提交者为 Hisashi Sugiura，发布年份为 2021 年。关于引用格式、许可条款与使用限制，源站未提供具体说明，使用前应查阅 NCBI 相关数据使用政策并遵循学术规范。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE174582
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
分析AD受累皮肤、AD未受累皮肤与正常皮肤之间基因表达的差异与相似性。通过微阵列分析找出AD特征性基因，并根据表达模式对这些基因进行分类。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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