FibConsensus v2.3：人类皮肤成纤维细胞程序的证据与可重复性档案及跨疾病空间验证

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22181279

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 236.2 MB。

数据说明

FibConsensus是一个来源感知的证据资源与分析框架，用于解决单细胞研究中人类皮肤成纤维细胞注释异质性的问题。冻结证据架构包含六个反复出现的共识成纤维细胞家族，这些家族源自系统性证据合成与跨研究裁定，其下属结构和状态水平结构则单独表示。2.3版本保留了完整的FibConsensus v2.2科学与可重复性档案，并新增了为《Genome Biology》v1.1手稿开发的空间验证扩展。该扩展在独立的空间转录组数据集中评估冻结的FibConsensus投影特征，这些数据集涵盖特应性皮炎（GSE197023）、银屑病（GSE225475）、瘢痕疙瘩（GSE181297），以及一个包含银屑病、特应性皮炎和扁平苔藓的多疾病数据集（GSE206391）。

v2.3 存档包含先前冻结的科学发布版本、机器可读的证据与溯源表、共识家族分配、投影签名、稳健性与敏感性分析、独立图谱验证与疾病重塑输出，以及新增的空间验证图（补充图 S6–S10）、图源数据、数据集级输出、分析脚本、配置文件、溯源记录、校验和，以及 Genome Biology v1.1 手稿快照。Genome Biology v1.1 空间验证快照关联至 Git 标签 genome-biology-v1.1 和 Git 提交 4a50ef666da929503778ef1093147ab8adf9267a。FibConsensus v2.2 仍为手稿最初提交时与之关联的不可变版本特定存档。版本 2.3 是纳入扩展空间验证的附加后续发布；它不修改已存档的 v2.2 发布版本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。