特应性皮炎与银屑病单细胞免疫应答对比 scRNA-seq 样本数据
数据覆盖皮肤疾病相关单细胞转录组测序原始读段，可用于免疫细胞分群、差异表达分析及两种炎症性皮肤病免疫机制的对比研究。实验设置的详细信息见原论文，源站未提供样本数量、物种、组织来源及测序平台等具体信息（来源 omicsdi.org）
基本信息
资源简介
特应性皮炎与银屑病单细胞免疫应答对比 scRNA-seq 样本数据
该数据集为一份单细胞转录组测序（scRNA-seq）原始数据集合，与一篇题为“Single-cell profiles reveal distinctive immune response in atopic dermatitis in contrast to psoriasis”的研究论文直接相关，包含该研究产生的 fastq 格式测序文件。数据集在分类上归属于皮肤疾病领域的“其他”类别，主题标签为 Genomics，来源站为 omicsdi.org。从整体定位看，它面向皮肤炎症性疾病免疫机制的单细胞层面研究，可用于免疫细胞分群、差异表达分析，以及特应性皮炎与银屑病两种疾病免疫应答特征的对比探索。实验设置的详细信息需参见原论文，源站未提供样本数量、物种、组织来源及测序平台等具体信息。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究关注特应性皮炎与银屑病这两种炎症性皮肤疾病在免疫应答上的差异。论文标题明确指出，研究通过单细胞图谱揭示特应性皮炎相对于银屑病所具有的独特免疫反应。数据集作为该论文的配套测序数据，承载了支撑这一对比分析任务的原始读段信息。其主题标签为 Genomics，说明数据本身属于基因组学范畴，具体表现为单细胞转录组测序的原始输出。数据集在来源站被归入皮肤疾病分类下的“其他”子类，反映出其研究对象属于皮肤疾病领域，但未进一步细分至特定疾病亚类。整体而言，该数据集为在单细胞分辨率下理解两种炎症性皮肤病的免疫机制差异提供了原始数据基础。
【数据内容】
数据集包含 scRNA-seq fastq 文件，即单细胞 RNA 测序产生的原始读段数据。fastq 格式通常保存测序读段序列及其对应的质量评分信息，是后续比对、定量和细胞水平表达分析的上游输入。根据源站描述，这些 fastq 文件与前述论文直接关联，用于支撑论文中关于特应性皮炎与银屑病免疫反应差异的单细胞分析。数据集的主题标签为 Genomics，进一步表明其内容属于基因组学数据。除 fastq 文件类型和与论文的关联外，源站未提供样本数量、物种、组织来源、测序平台、读长、测序深度等具体技术参数。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述说明，这些 scRNA-seq fastq 文件对应一篇已发表论文，论文题目为“Single-cell profiles reveal distinctive immune response in atopic dermatitis in contrast to psoriasis”，实验设置的详细信息在原论文中有所描述。数据集英文名称为“f1bd3ddd-2c80-4e2b-82a9-917d22961764 - samples”。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者特征等，源站未提供。
【适用场景】
基于其单细胞转录组原始读段的属性，该数据集适用于以下分析方向：免疫细胞分群，即在单细胞水平识别和划分不同免疫细胞类型或状态；差异表达分析，即比较不同条件或不同疾病背景下基因表达的变化；以及特应性皮炎与银屑病两种炎症性皮肤疾病免疫机制的对比研究。由于数据为 fastq 格式，使用者通常需要经过比对、定量和质控等上游处理流程，才能获得可用于细胞分群和差异表达分析的表达矩阵。该数据集也可作为单细胞分析方法开发或基准测试的输入数据，但具体适用性取决于使用者对实验设计和样本组成的理解，而这些信息需参考原论文。
【使用方法】
使用该数据集时，一般流程包括：获取 fastq 文件后，进行测序质量控制，去除低质量读段和接头污染；随后将读段比对至参考基因组或转录组；再进行基因表达定量，生成细胞-基因表达矩阵；接着进行细胞质控、归一化、降维聚类和细胞类型注释；最后根据研究目的开展免疫细胞分群、差异表达分析或疾病间对比分析。由于源站未提供样本数量、物种、组织来源及测序平台等信息，使用者在设计分析流程前应查阅原论文以确认参考基因组版本、建库方式和测序参数等关键细节。源站未提供具体的使用说明或分析脚本。
【质量与限制】
该数据集为原始 fastq 读段，其质量取决于原始测序实验和建库过程，但源站未提供质量评估指标，如碱基质量分布、比对率、细胞数、基因数等。源站也未提供样本数量、物种、组织来源、测序平台、读长和测序深度等信息，这些缺失会限制使用者在不查阅原论文的情况下独立判断数据的适用范围和分析可行性。此外，数据集在来源站被归入皮肤疾病分类下的“其他”，未进一步细分疾病类型，但源站描述明确指向特应性皮炎与银屑病的对比研究。总体而言，该数据集的核心限制在于元数据不完整，使用者需依赖原论文获取实验设计和样本层面的详细信息。
【引用与许可】
该数据集与论文“Single-cell profiles reveal distinctive immune response in atopic dermatitis in contrast to psoriasis”直接相关，使用时应引用该论文。数据集来源站为 omicsdi.org。关于数据集的许可协议、使用条款、访问限制或再分发条件，源站未提供。使用者应在获取数据时自行确认来源站或原论文中可能列出的许可与使用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001010106
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含与论文《单细胞图谱揭示特应性皮炎与银屑病截然不同的免疫反应》相关的scRNA-seq fastq文件。实验设置的详细情况在论文中有所描述。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
