盘状狼疮转录组与银屑病比较揭示Th1优势及Th17偏移极小
该数据集来自omicsdi.org,聚焦皮肤疾病中的盘状狼疮(DLE)。源站描述显示,研究对DLE皮肤进行了转录组分析,以识别可用于治疗靶点的信号通路和细胞特征,并与银屑病转录组比较以寻找潜在治疗靶点

基本信息
资源简介
盘状狼疮转录组与银屑病比较揭示Th1优势及Th17偏移极小
该数据集来自omicsdi.org,聚焦皮肤疾病中的盘状狼疮(DLE)。源站描述显示,研究对DLE皮肤进行了转录组分析,以识别可用于治疗靶点的信号通路和细胞特征,并与银屑病转录组比较以寻找潜在治疗靶点。数据表明DLE中IFN-γ相关基因相对富集,而IL-17相关基因未见富集。该数据可用于转录组比较分析及皮肤疾病分子机制研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):盘状红斑狼疮(DLE)是狼疮最常见的皮肤表现。尽管其在系统性狼疮中发生率高,且也存在无皮肤外表现的患者,但针对DLE的靶向治疗仍然缺乏,很可能是因为对DLE皮肤分子格局的认识不足。在此,我们对DLE皮肤的转录组进行了分析,以识别可能作为治疗靶点的信号通路和细胞特征。进一步将DLE转录组与银屑病转录组进行比较——鉴于我们对银屑病分子通路的广泛了解,银屑病是一个有用的参照——为识别潜在治疗靶点提供了框架。尽管越来越多的数据支持IL-17和辅助性T细胞17(Th17)在系统性狼疮中的作用,但我们显示DLE中IFN-γ相关基因相对富集,而IL-17相关基因未见富集。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:皮肤疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-52471
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-52471
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
盘状红斑狼疮(DLE)是狼疮最常见的皮肤表现。尽管其在系统性狼疮中发生率高,且也存在无皮肤外表现的患者,但针对DLE的靶向治疗仍然缺乏,这很可能是因为对DLE皮肤的分子图谱了解不足。在此,我们对DLE皮肤的转录组进行了分析,以识别可能作为治疗靶点的信号通路和细胞特征。进一步将DLE转录组与银屑病转录组进行比较——鉴于我们对银屑病分子通路的丰富知识,银屑病是一个有用的参照——为识别潜在治疗靶点提供了框架。尽管越来越多的数据支持IL-17和辅助性T细胞17型(Th17)细胞在系统性狼疮中的作用,但我们显示DLE中IFN-γ相关基因相对富集,而IL-17相关基因则未见富集。从DLE患者皮肤中提取T细胞后发现,以产生IFN-γ的Th1细胞为主,而缺乏产生IL-17的Th17细胞,这与全皮肤转录组分析的结果相辅相成。
因此,这些数据支持针对Th1细胞或IFN-γ信号通路的DLE治疗方法的研究。皮肤状况之间的转录组比较
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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