接触性皮炎皮肤分子谱分析:过敏原依赖性免疫应答差异数据
该数据集来自 ebi.ac.uk,标题为接触性皮炎皮肤分子谱分析揭示过敏原依赖性免疫应答差异。源站描述指出,不同过敏原诱导不同的免疫应答,数据为皮肤斑贴试验后针对特定过敏原获得的基因组谱分析

基本信息
资源简介
接触性皮炎皮肤分子谱分析:过敏原依赖性免疫应答差异数据
该数据集围绕接触性皮炎皮肤的分子谱分析展开,旨在揭示不同过敏原所诱导的免疫应答差异。其英文名称为“Data from: Molecular profiling of contact dermatitis skin identifies allergen-dependent differences in immune response”,源站标题与英文名称一致。数据集来源于 ebi.ac.uk,在本站被归类为皮肤疾病 / 其他。源站描述指出,不同过敏原诱导不同的免疫应答,数据为皮肤斑贴试验后针对特定过敏原获得的基因组谱分析。主题标签包括“transcription profiling by array”和“Homo sapiens”,表明该数据集涉及人类样本的转录谱芯片分析。整体而言,该数据集为研究接触性皮炎中过敏原特异性免疫机制提供了分子层面的数据基础。
【数据集背景】
接触性皮炎是一种与免疫应答相关的皮肤疾病,其发生往往与特定过敏原的暴露有关。不同过敏原可能触发不同的免疫通路和基因表达模式,因此从分子水平上区分这些差异,对于理解疾病机制具有重要意义。该数据集正是基于这一背景,通过皮肤斑贴试验获取针对特定过敏原的样本,并开展基因组谱分析,以探索过敏原依赖性免疫应答的差异。源站描述强调“不同过敏原诱导不同的免疫应答”,这构成了该数据集的核心科学问题。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“transcription profiling by array”和“Homo sapiens”,说明其内容属于人类转录谱芯片数据。数据聚焦于接触性皮炎皮肤在斑贴试验后针对特定过敏原的基因组谱分析。源站描述提到“genomic profiling of specific allergen obtained after patched tests in skin”,即皮肤斑贴试验后获得的特定过敏原基因组谱。数据集的英文名称和源站标题均指向“接触性皮炎皮肤分子谱分析揭示过敏原依赖性免疫应答差异”,进一步明确了数据内容与过敏原依赖性免疫应答的关联。关于具体的样本数量、基因数量、芯片平台型号、表达值范围等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述指出,数据获取方式为皮肤斑贴试验后针对特定过敏原进行基因组谱分析。受试对象为人类(Homo sapiens),分析类型为转录谱芯片(transcription profiling by array)。关于采集时间、采集地点、受试者招募标准、伦理审批信息、样本处理流程等具体内容,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于接触性皮炎相关的基础与转化研究,尤其是需要从转录组层面比较不同过敏原诱导的免疫应答差异的场景。例如,研究人员可利用该数据探索过敏原特异性基因表达特征、识别潜在的免疫通路差异,或为后续生物标志物发现提供线索。此外,由于主题标签涉及“Homo sapiens”和“transcription profiling by array”,该数据集也可用于人类皮肤免疫应答的芯片数据整合分析。关于具体的适用疾病亚型、过敏原种类或临床分层,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取。源站描述提及数据为皮肤斑贴试验后针对特定过敏原获得的基因组谱分析,主题标签为“transcription profiling by array”,表明数据以芯片转录谱形式组织。关于数据下载格式、预处理步骤、归一化方法、分析工具推荐等具体使用说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站标题和描述均指向接触性皮炎皮肤的分子谱分析。主题标签明确为“transcription profiling by array”和“Homo sapiens”。然而,关于样本量、重复数、数据完整性、批次效应、平台注释版本、缺失值处理等质量相关信息,源站未提供。此外,该数据集是否涵盖多种过敏原、是否包含对照组、是否经过独立验证等限制性信息,源站亦未提供。因此,在使用该数据集时,需结合源站实际提供的数据文件与文档进行评估。
【引用与许可】
该数据集的英文名称为“Data from: Molecular profiling of contact dermatitis skin identifies allergen-dependent differences in immune response”,源站标题为“Molecular profiling of contact dermatitis skin identifies allergen-dependent differences in immune response”。关于具体的引用格式、作者列表、发表期刊、DOI、许可协议类型、使用限制等引用与许可信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-60028
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Joel Correa da Rosa; Joel da Rosa; Nikhil Dighra (2014). Molecular profiling of contact dermatitis skin identifies allergen-dependent differences in immune response [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-60028
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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