人类皮肤记忆T细胞单细胞转录梯度限制Th17/Tc17身份
该数据集来自omicsdi.org，包含两部分：一是针对炎症抑制程序核心组分ZFP36L2和ZFP36进行CRISPR失活的人PBMC bulk RNA-seq；二是银屑病患者在接受IL-23阻断治疗前及治疗期间的皮肤免疫细胞scRNA-seq
基本信息
资源简介
人类皮肤记忆T细胞单细胞转录梯度限制Th17/Tc17身份
该数据集聚焦人类皮肤记忆T细胞中限制Th17/Tc17身份的转录梯度现象，来源于omicsdi.org，归类于皮肤疾病/其他方向，主题标签为基因组学。数据集围绕银屑病相关炎症抑制程序展开，包含两类转录组数据：一是针对该炎症抑制程序中两个核心组分ZFP36L2与ZFP36，在人外周血单个核细胞（PBMC）中进行CRISPR失活后的bulk RNA-seq；二是银屑病患者在接受IL-23阻断治疗前及治疗期间的皮肤免疫细胞scRNA-seq。整体设计旨在从基因调控与细胞状态两个层面，刻画银屑病皮损中驻留记忆T细胞的炎症抑制性转录程序及其在靶向治疗下的变化。
【数据集背景】
银屑病是一种由免疫系统异常激活驱动的慢性皮肤炎症性疾病，IL-23/Th17轴在其发病机制中占据核心地位。驻留记忆T细胞长期驻留于皮肤组织，是疾病复发的重要细胞基础。该数据集所依托的研究识别出银屑病驻留记忆T细胞中存在一个协同调控的、具有梯度特征的炎症抑制性基因表达程序，并锁定ZFP36L2与ZFP36为该程序的两个核心组分。这一背景使数据集同时具备机制探索与临床干预观察的双重价值：一方面通过CRISPR失活验证核心基因的功能地位，另一方面通过IL-23阻断治疗前后的皮肤免疫细胞图谱，观察该程序在治疗干预下的动态变化。
【数据内容】
数据集包含两部分内容。第一部分为bulk RNA-seq数据，对象是在人PBMC中对炎症抑制程序的两个核心组分ZFP36L2和ZFP36实施CRISPR-based deactivation后的转录组样本，用于评估这两个基因失活所引起的整体转录响应。第二部分为scRNA-seq数据，对象为银屑病患者的皮肤免疫细胞，采样时间覆盖治疗前以及治疗期间（即IL-23 blockade治疗过程中），可在单细胞分辨率上比较皮肤免疫细胞组成与转录状态的动态改变。两部分数据分别从批量转录组和单细胞转录组两个层次支撑对炎症抑制程序及其调控关系的分析。
【采集与来源】
数据集来源于omicsdi.org。根据源站描述，其数据产生于对人类PBMC的CRISPR失活实验以及对银屑病患者皮肤免疫细胞的单细胞转录组测序，患者样本覆盖IL-23阻断治疗前与治疗期间两个时间阶段。关于样本量、采集部位的具体解剖信息、测序平台、试剂型号、伦理审批信息等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下方向的分析：银屑病驻留记忆T细胞中炎症抑制性转录程序的机制研究；ZFP36L2与ZFP36在PBMC中的功能失活转录效应分析；Th17/Tc17身份限制与转录梯度关系的探索；IL-23阻断治疗前后皮肤免疫细胞单细胞图谱的比较研究；以及批量转录组与单细胞转录组数据的整合分析。主题标签为基因组学，适合转录组层面的再分析与方法学验证。
【使用方法】
使用时可分别处理两部分数据：bulk RNA-seq部分可用于差异表达分析、通路富集分析以及CRISPR失活靶基因的转录响应评估；scRNA-seq部分可用于细胞类型注释、亚群比较、治疗前后细胞状态差异分析以及候选基因在细胞群中的表达定位。若需联合分析，可将bulk层面得到的ZFP36L2/ZFP36相关响应基因集投射到单细胞数据中，考察其在皮肤免疫细胞亚群中的分布。具体的比对流程、标准化参数与质控阈值，源站未提供。
【质量与限制】
源站描述未给出测序深度、细胞数、重复数、批次信息及质控指标，因此无法对数据质量作出具体判断。数据集仅覆盖PBMC的CRISPR失活实验与银屑病患者皮肤免疫细胞的治疗前后样本，关于健康对照、其他疾病类型或更长时间随访的信息，源站未提供。使用时应结合原始数据的技术参数自行评估适用性。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001006716
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们在银屑病 resident memory T 细胞中鉴定出一个梯度化的转录程序，该程序由协同调控的炎症抑制基因组成。该数据集包括在人类 PBMC 中基于 CRISPR 对炎症抑制程序的两个核心组分 ZFP36L2 和 ZFP36 进行失活处理的 bulk RNA-seq。它还包括来自银屑病患者在接受治疗性 IL-23 阻断之前和期间的皮肤免疫细胞的 scRNA-seq。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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