银屑病患者皮肤免疫细胞scRNA-seq与ZFP36L2敲除T细胞RNA-seq样本集

资源简介

银屑病患者皮肤免疫细胞scRNA-seq与ZFP36L2敲除T细胞RNA-seq样本集

该数据集收录于omicsdi.org，主题标签为Genomics，本站归类为皮肤疾病/其他。数据集由两部分相互独立的样本组成：第一部分为银屑病患者皮肤免疫细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，覆盖接受Tildrakizumab治疗前与治疗后的患者，样本以BAM文件格式提供；第二部分为ZFP36L2基因CRISPR敲除的人T细胞RNA-seq数据，样本以FASTQ文件格式提供。两部分数据分别对应银屑病皮肤免疫微环境的单细胞转录组观察与T细胞中特定基因功能缺失后的转录组变化，共同构成一个以皮肤疾病免疫机制与基因功能研究为指向的基因组学数据集合。

【数据集背景】

该数据集来源于omicsdi.org，主题标签为Genomics，本站分类为皮肤疾病/其他。从源站描述可知，数据集围绕两类研究场景构建：一是银屑病患者皮肤免疫细胞在Tildrakizumab治疗前后的单细胞转录组特征，二是ZFP36L2基因经CRISPR敲除后的人T细胞转录组特征。银屑病是一种免疫介导的皮肤疾病，皮肤免疫细胞在其发病与治疗响应中具有重要地位；Tildrakizumab治疗前与治疗后样本的配对设计，使该数据具备观察治疗相关免疫细胞转录状态变化的潜力。ZFP36L2 CRISPR敲除人T细胞部分则提供了在体外对特定基因进行功能失活后开展转录组分析的材料。两部分数据均以基因组学测序为核心手段，服务于皮肤疾病与免疫细胞基因功能相关研究。

【数据内容】

数据集包含两个部分。第一部分为银屑病患者皮肤免疫细胞的scRNA-seq数据，样本涵盖Tildrakizumab治疗前与治疗后的患者，文件格式为BAM。源站描述中列出的样本标识包括19006FL-25-01、19006FL-38-01、19006FL-32-01-03、19006FL-33-01、19006FL-28-01-05、19006FL-35-01-01。第二部分为ZFP36L2 CRISPR敲除的人T细胞RNA-seq数据，文件格式为FASTQ，列出的样本标识包括19006XR-30-05、19006XR-30-04、19006XR-30-02、19006XR-30-01、19006XR-26-05、19006XR-26-04、19006XR-26-02、19006XR-26-01、19006R-22-04、19006R-22-08、19006R-22-05、19006R-22-01。两部分在样本类型、测序策略与文件格式上均不相同，使用时应分别处理。

【采集与来源】

该数据集来源站为omicsdi.org。源站描述说明，第一部分样本来自银屑病患者，包括Tildrakizumab治疗前与治疗后的患者皮肤免疫细胞；第二部分样本为ZFP36L2 CRISPR敲除的人T细胞。除上述来源与样本类型说明外，源站未提供具体的采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者人口学特征及临床评分等细节。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集可用于以下方向：银屑病患者皮肤免疫细胞在Tildrakizumab治疗前后转录状态差异的探索性分析；皮肤免疫细胞单细胞层面的细胞类型组成与基因表达特征研究；ZFP36L2基因敲除对人T细胞转录组影响的比较分析；以及围绕皮肤疾病免疫机制与T细胞基因功能的基因组学方法学研究。由于数据同时包含治疗前后样本与基因敲除样本，也可作为免疫相关转录组分析流程的练习或方法验证材料。具体研究用途需结合样本标识与实验设计自行判断，源站未提供推荐分析方案。

【使用方法】

第一部分scRNA-seq数据以BAM格式提供，使用前需按单细胞RNA测序常规流程进行比对文件处理、表达定量与细胞层面质控；由于涉及治疗前与治疗后样本，分析时应依据样本标识区分处理组别。第二部分RNA-seq数据以FASTQ格式提供，需经过读段质控、比对或定量等常规转录组分析步骤；涉及ZFP36L2敲除与对照的比较时，应依据样本标识确认分组关系。两部分数据格式不同，建议分别建立分析流程。源站未提供具体的分析参数、参考基因组版本、标准化流程或代码。

【质量与限制】

源站未提供测序深度、读段质量、细胞数量、基因检出数、重复样本一致性等质量指标，也未提供批次信息、缺失值情况或数据过滤标准。样本标识虽已列出，但源站未说明各标识与治疗前/治疗后、敲除/对照之间的对应关系，使用者在分组时需谨慎核实。此外，源站未提供临床元数据、患者个体信息及实验操作细节，可能限制对治疗响应或基因敲除效应的深入解释。数据仅覆盖源站描述所列内容，不宜外推至其他人群、其他治疗或其他基因。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、发表文献、DOI、许可协议或使用条款。使用者在二次利用前应向数据来源站核实引用要求与许可条件。