2019 未治疗 JDM RNA-Seq：Read Group 信息
该数据集来自一项 RNA-Seq 实验，围绕未治疗与静止期 juvenile dermatomyositis（JDM）的转录组改变，并涵盖 JDM 皮肤与对照皮肤、JDM 肌肉与对照肌肉的比较
基本信息
资源简介
2019 未治疗 JDM RNA-Seq：Read Group 信息
2019 Untreated JDM RNA-Seq: Read Group info
该数据集来自一项 RNA-Seq 实验，围绕未治疗与静止期 juvenile dermatomyositis（JDM）的转录组改变，并涵盖 JDM 皮肤与对照皮肤、JDM 肌肉与对照肌肉的比较。数据内容为 read group 信息，用于将每个唯一的 Read Group IDentifier（RGID）与 Read Group SaMple（RGSM）对应起来，以支持差异表达分析。文件共 2 个，样例为 JDM_RNASeq_ReadGroup_Info.csv。该数据可用于 JDM 相关转录组研究的样本映射与差异表达分析流程搭建（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
项目资助方：R21-AR066846。源站首次发布：2020-09-29。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：这是一个与 RNA-Seq 实验相关的数据集，该实验考察 1) 未治疗和静止期 juvenile dermatomyositis 中的转录组改变，2) JDM 皮肤与对照皮肤，以及 3) JDM 肌肉与对照肌肉。read group 信息映射了每个唯一的 Read Group IDentifier（RGID）与 Read Group SaMple（RGSM）之间的关系，用于差异表达分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 12.98 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.8150696.v2。
【主题与分类】
源站学科分类：Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)、Genomics、Immunology not elsewhere classified。主题标签：juvenile dermatomyositis、peripheral blood mononuclear cells、PBMCs、autoimmune disease、RNA-Seq、skin、muscle、Bioinformatics、Genomics、Immunology。本站分类：皮肤疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)、Genomics、Immunology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/2019_Untreated_JDM_RNA-Seq_Read_Group_info/8150696
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Roberson, Elisha (2019). 2019 Untreated JDM RNA-Seq: Read Group info. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.8150696.v1
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 13.0 KB。
数据说明
这是一个与RNA-Seq实验相关的数据集，该实验旨在探究：1）未经治疗和处于非活动期的幼年皮肌炎中的转录组变化，以及2）另一组后来发展为银屑病的非活动期JDM患者队列。读取组信息映射了每个唯一读取组标识符与用于差异表达的读取组样本之间的关系。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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