2019 未治疗 JDM RNA-Seq:DAS 评分

这是一个与 RNA-Seq 实验相关的数据集,该实验检查 1)未治疗和 inactive juvenile dermatomyositis 中的转录组改变,以及 2)一个后续发展为 psoriasis 的 inactive JDM 患者独立队列

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2020-10-17 更新
浏览 9
基因组回归juvenile dermatomyositisperipheral blood mononuclear cellsPBMCspsoriasisautoimmune diseaseRNA-SeqBioinformaticsGenomicsImmunology
2019 Untreated JDM RNA-Seq: DAS scores

基本信息

模态
基因组
大小
0.000002506 GB
任务类型
回归
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2020-10-17
版本
v3

资源简介

2019 未治疗 JDM RNA-Seq:DAS 评分

2019 Untreated JDM RNA-Seq: DAS scores

该数据集来自一项 RNA-Seq 实验,包含未治疗和 inactive juvenile dermatomyositis(JDM)患者的转录组改变,以及一个后续发展为 psoriasis 的 inactive JDM 患者独立队列。本文件提供每位个体的 Disease Activity Scores(DAS),用于 Weighted Gene Correlation Network Analysis。数据共 3 个文件,样例为 JDM_RNASeq_DAS_Info.csv,由 Elisha Roberson 于 2020-10-17 发布,DOI 为 10.6084/m9.figshare.8150702.v3。可用于 JDM 疾。

【数据集背景】

项目资助方:R21-AR066846。源站首次发布:2020-10-17。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):这是一个与 RNA-Seq 实验相关的数据集,该实验检查 1)未治疗和 inactive juvenile dermatomyositis 中的转录组改变,以及 2)一个后续发展为 psoriasis 的 inactive JDM 患者独立队列。本文件包含每位个体的 Disease Activity Scores(DAS),用于 Weighted Gene Correlation Network Analysis。

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 2.51 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.8150702.v3。

【主题与分类】

源站学科分类:Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)、Genomics、Immunology not elsewhere classified。主题标签:juvenile dermatomyositis、peripheral blood mononuclear cells、PBMCs、psoriasis、autoimmune disease、RNA-Seq、Bioinformatics、Genomics、Immunology。本站分类:皮肤疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)、Genomics、Immunology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/2019_Untreated_JDM_RNA-Seq_DAS_scores/8150702

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Roberson, Elisha (2019). 2019 Untreated JDM RNA-Seq: DAS scores. figshare. Dataset

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.8150702.v3

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 2.5 KB。

数据说明

这是一个与RNA-Seq实验相关的数据集,该实验旨在研究:1)未经治疗和处于非活动期的幼年皮肌炎患者的转录组变化,以及2)另一组后来发展为银屑病的非活动期JDM患者队列。此文件包含了每位个体的疾病活动评分(DAS),这些评分用于加权基因共表达网络分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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