银屑病患者皮肤活检免疫细胞单细胞RNA-seq分析样本

该数据集来源于omicsdi.org,为银屑病患者接受IL-23阻断治疗期间皮肤活检分离的皮肤免疫细胞单细胞RNA-seq分析样本

omicsdi
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医学影像Genomics
109eef22-1de3-448f-9272-63a1fd428ff1 - samples

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

银屑病患者皮肤活检免疫细胞单细胞RNA-seq分析样本

该数据集为一份单细胞转录组学样本数据,英文名称为“109eef22-1de3-448f-9272-63a1fd428ff1 - samples”,来源于组学数据资源平台 omicsdi.org,在本站归入皮肤疾病分类下的“其他”子类,主题标签为 Genomics。其源站描述表明,该数据涉及对银屑病患者接受 IL-23 阻断治疗期间、从皮肤活检中分离的皮肤免疫细胞所进行的单细胞 RNA-seq 分析。换言之,这是一份围绕银屑病在生物制剂干预背景下皮肤局部免疫细胞状态的研究样本集合,属于基因组学范畴的单细胞层面数据资源。以下依据可获得的信息,从背景、内容、来源、用途、使用方式、局限及引用等方面对该数据集作进一步说明。

【数据集背景】

银屑病是一种与免疫系统异常活化相关的慢性皮肤疾病,其发病机制涉及多种免疫细胞在皮肤局部的浸润与相互作用。IL-23 是参与该类炎症反应的重要细胞因子通路之一,针对 IL-23 的阻断治疗已成为相关临床干预的方向。该数据集正是围绕这一治疗背景产生,关注患者在接受 IL-23 阻断期间皮肤活检样本中的免疫细胞。通过单细胞 RNA-seq 技术,可在单个细胞水平上观察皮肤免疫细胞的转录状态,从而为理解治疗过程中局部免疫环境的变化提供数据基础。该数据集在本站被归入皮肤疾病分类,主题标签为 Genomics,说明其核心属性是基因组学层面的测量数据,而非临床影像或病理切片等类型。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集的内容为皮肤免疫细胞的单细胞 RNA-seq 分析样本,样本来自银屑病患者接受 IL-23 阻断治疗期间的皮肤活检。数据名称中包含“samples”字样,表明其以样本为单位组织。数据所覆盖的具体样本数量、测序平台、文库构建方式、细胞数量、基因表达矩阵格式、是否包含原始测序读段或仅包含处理后表达矩阵等信息,源站未提供。除主题标签 Genomics 外,未给出更细的组学层面标注。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出,其分析对象为从银屑病患者皮肤活检中分离的皮肤免疫细胞,且这些患者正处于 IL-23 阻断治疗期间。关于活检采集的具体部位、采集时间点、患者纳入与排除标准、伦理审批信息、样本处理与免疫细胞分离的具体流程,源站未提供。数据在本站的分类为皮肤疾病 / 其他,这一归类反映了其与皮肤疾病研究的关联,但未进一步说明所属的具体疾病亚类或研究队列信息。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于与银屑病皮肤免疫微环境相关的研究场景,尤其是关注 IL-23 阻断治疗背景下皮肤免疫细胞转录特征的分析。其单细胞 RNA-seq 属性使其适合用于细胞类型组成、细胞状态差异及免疫细胞间异质性等方向的数据探索。由于主题标签为 Genomics,该数据也可作为基因组学数据资源被检索和整合。需要说明的是,上述适用方向系依据数据主题与源站描述所作的通用性说明,源站未提供该数据集的具体研究结论、分析结果或验证用途。

【使用方法】

该数据集以样本形式组织,名称中包含“samples”,使用时可将其视为单细胞 RNA-seq 样本集合进行检索与获取。关于数据的具体下载地址、文件格式、数据规模、是否提供配套元数据表、是否需要专用分析流程或参考基因组版本等信息,源站未提供。因此,实际使用前需依据 omicsdi.org 上的原始条目确认获取方式与数据组织形态。源站未提供标准化的使用说明或分析指南。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息,包括测序深度、细胞存活率、数据完整性、批次效应控制及质控标准等。由于缺少样本量、平台与处理流程等细节,无法对数据的适用范围与可靠性作出进一步判断。该数据集在本站归入“其他”子类,说明其分类信息较为宽泛,使用时应注意结合源站条目核实具体研究背景。此外,源站描述仅涉及银屑病患者接受 IL-23 阻断治疗期间的皮肤免疫细胞,未提供对照设计、时间序列设计或与其他治疗方案的比较信息,相关限制需以源站原始记录为准。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、文献出处、DOI、许可协议或使用条款等信息。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅 omicsdi.org 上对应条目的原始说明,以确认署名要求与使用限制。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001011103

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Single-cell RNA-seq analysis of cutaneous immune cells isolated from skin biopsies of psoriasis patients undergoing IL-23 blockade

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